Protein–RNA interactions for Protein: D3YZF7

Vsig10l, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like, mousemouse

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10lD3YZF7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,17■■■■□ 3,38
Vsig10lD3YZF7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Vsig10lD3YZF7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Vsig10lD3YZF7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Vsig10lD3YZF7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Vsig10lD3YZF7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Vsig10lD3YZF7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Vsig10lD3YZF7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Vsig10lD3YZF7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Vsig10lD3YZF7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Vsig10lD3YZF7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Vsig10lD3YZF7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Vsig10lD3YZF7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Vsig10lD3YZF7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Vsig10lD3YZF7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Vsig10lD3YZF7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Vsig10lD3YZF7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Vsig10lD3YZF7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Vsig10lD3YZF7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Vsig10lD3YZF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Vsig10lD3YZF7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Vsig10lD3YZF7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Vsig10lD3YZF7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Vsig10lD3YZF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Vsig10lD3YZF7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Vsig10lD3YZF7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Vsig10lD3YZF7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Vsig10lD3YZF7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Vsig10lD3YZF7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Vsig10lD3YZF7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Vsig10lD3YZF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Vsig10lD3YZF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Vsig10lD3YZF7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Vsig10lD3YZF7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Vsig10lD3YZF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Vsig10lD3YZF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Vsig10lD3YZF7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Vsig10lD3YZF7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Vsig10lD3YZF7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Vsig10lD3YZF7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Vsig10lD3YZF7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Vsig10lD3YZF7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Vsig10lD3YZF7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Vsig10lD3YZF7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Vsig10lD3YZF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Vsig10lD3YZF7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Vsig10lD3YZF7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Vsig10lD3YZF7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Vsig10lD3YZF7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Vsig10lD3YZF7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vsig10lD3YZF7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Vsig10lD3YZF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Vsig10lD3YZF7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Vsig10lD3YZF7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Vsig10lD3YZF7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Vsig10lD3YZF7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Vsig10lD3YZF7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Vsig10lD3YZF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Vsig10lD3YZF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Vsig10lD3YZF7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Vsig10lD3YZF7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Vsig10lD3YZF7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Vsig10lD3YZF7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Vsig10lD3YZF7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Vsig10lD3YZF7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Vsig10lD3YZF7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,52■■■□□ 2
Vsig10lD3YZF7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Vsig10lD3YZF7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Vsig10lD3YZF7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Vsig10lD3YZF7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Vsig10lD3YZF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Vsig10lD3YZF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Vsig10lD3YZF7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Vsig10lD3YZF7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Vsig10lD3YZF7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Vsig10lD3YZF7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Vsig10lD3YZF7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Vsig10lD3YZF7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Vsig10lD3YZF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Vsig10lD3YZF7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Vsig10lD3YZF7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Vsig10lD3YZF7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Vsig10lD3YZF7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Vsig10lD3YZF7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Vsig10lD3YZF7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Vsig10lD3YZF7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Vsig10lD3YZF7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Vsig10lD3YZF7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Vsig10lD3YZF7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Vsig10lD3YZF7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Vsig10lD3YZF7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
Vsig10lD3YZF7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Vsig10lD3YZF7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vsig10lD3YZF7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vsig10lD3YZF7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Vsig10lD3YZF7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Vsig10lD3YZF7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Vsig10lD3YZF7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Vsig10lD3YZF7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Vsig10lD3YZF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,6 ms