Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cops7bQ8BV13 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cops7bQ8BV13 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cops7bQ8BV13 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cops7bQ8BV13 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cops7bQ8BV13 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cops7bQ8BV13 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cops7bQ8BV13 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Cops7bQ8BV13 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Cops7bQ8BV13 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cops7bQ8BV13 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Cops7bQ8BV13 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Cops7bQ8BV13 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cops7bQ8BV13 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cops7bQ8BV13 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cops7bQ8BV13 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cops7bQ8BV13 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cops7bQ8BV13 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cops7bQ8BV13 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cops7bQ8BV13 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cops7bQ8BV13 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cops7bQ8BV13 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cops7bQ8BV13 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cops7bQ8BV13 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cops7bQ8BV13 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cops7bQ8BV13 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cops7bQ8BV13 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cops7bQ8BV13 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cops7bQ8BV13 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cops7bQ8BV13 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cops7bQ8BV13 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cops7bQ8BV13 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cops7bQ8BV13 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cops7bQ8BV13 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cops7bQ8BV13 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cops7bQ8BV13 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cops7bQ8BV13 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cops7bQ8BV13 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cops7bQ8BV13 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cops7bQ8BV13 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cops7bQ8BV13 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cops7bQ8BV13 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cops7bQ8BV13 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cops7bQ8BV13 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cops7bQ8BV13 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cops7bQ8BV13 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cops7bQ8BV13 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cops7bQ8BV13 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cops7bQ8BV13 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cops7bQ8BV13 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cops7bQ8BV13 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cops7bQ8BV13 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cops7bQ8BV13 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cops7bQ8BV13 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cops7bQ8BV13 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cops7bQ8BV13 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cops7bQ8BV13 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cops7bQ8BV13 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cops7bQ8BV13 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cops7bQ8BV13 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cops7bQ8BV13 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cops7bQ8BV13 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cops7bQ8BV13 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cops7bQ8BV13 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cops7bQ8BV13 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cops7bQ8BV13 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cops7bQ8BV13 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cops7bQ8BV13 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cops7bQ8BV13 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cops7bQ8BV13 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cops7bQ8BV13 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cops7bQ8BV13 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cops7bQ8BV13 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cops7bQ8BV13 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cops7bQ8BV13 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cops7bQ8BV13 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cops7bQ8BV13 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cops7bQ8BV13 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cops7bQ8BV13 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cops7bQ8BV13 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cops7bQ8BV13 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cops7bQ8BV13 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cops7bQ8BV13 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cops7bQ8BV13 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cops7bQ8BV13 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cops7bQ8BV13 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cops7bQ8BV13 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cops7bQ8BV13 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cops7bQ8BV13 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cops7bQ8BV13 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cops7bQ8BV13 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops7bQ8BV13 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops7bQ8BV13 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops7bQ8BV13 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cops7bQ8BV13 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cops7bQ8BV13 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cops7bQ8BV13 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cops7bQ8BV13 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cops7bQ8BV13 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cops7bQ8BV13 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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