RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 SYVN1Q86TM6 617 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TEX19Q8NA77 164 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 RSC1A1Q92681 617 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 RITA1Q96K30 269 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 LRFN5Q96NI6 719 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TGM7Q96PF1 710 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 VAT1Q99536 393 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 LHX9Q9NQ69 397 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 RARRES3Q9UL19 164 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PADI1Q9ULC6 663 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 J3KTA2 159 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PRAMEF2O60811 474 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 USP1O94782 785 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ITGA5P08648 1049 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 HLA-DPA1P20036 260 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 F8A1P23610 371 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 CASP14P31944 242 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 GJC1P36383 396 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 SPAM1P38567 509 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 UBASH3AP57075 661 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 GSDMDP57764 484 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TUBB4BP68371 445 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 AP1B1Q10567 949 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 LAMB3Q13751 1172 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TUBB2AQ13885 445 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TFDP2Q14188 446 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TAZQ16635 292 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PFKFB4Q16877 469 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TEX44Q53QW1 395 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ALS2CLQ60I27 953 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 IRGCQ6NXR0 463 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM65Q6PI78 240 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 AMZ2Q86W34 360 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 RAPGEF5Q92565 580 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PMM1Q92871 262 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TTC25Q96NG3 672 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ACTL8Q9H568 366 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 BTRCQ9Y297 605 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 OR5K3A6NET4 321 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 WIPF3A6NGB9 483 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 AQP12BA6NM10 295 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PSTPIP1O43586 416 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PTPN3P26045 913 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 NDUFS1P28331 727 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PTPN4P29074 926 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 PDE1BQ01064 536 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 ERV3-1Q14264 604 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 IGFBP7Q16270 282 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 BCL7AQ4VC05 210 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 OOSP2Q86WS3 158 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-222ENST00000514552 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.53□□□□□ -1.36
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