RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 VAMP1P23763 118 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SLC6A6P31641 620 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF763Q0D2J5 394 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 OR4K14Q8NGD5 310 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PSAT1Q9Y617 370 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 MYOM1P52179 1685 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FEZF1A0PJY2 475 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 IFNA21P01568 189 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SHMT2P34897 504 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 DSG2Q14126 1118 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SLC15A3Q8IY34 581 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 OR8S1Q8NH09 359 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FBXL20Q96IG2 436 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 AIFM2Q9BRQ8 373 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A1O15245 554 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SPARCP09486 303 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEA11P43364 429 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM80Q96HE8 168 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 MEAF6Q9HAF1 191 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 HTR3EA5X5Y0 456 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 BEST1O76090 585 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PDYNP01213 254 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SLC36A4Q6YBV0 504 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT10Q86SR1 603 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 BADQ92934 168 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 OR2M4Q96R27 311 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 STRADBQ9C0K7 418 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA12AO43301 675 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FOSL2P15408 326 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 NRROSQ86YC3 692 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PP18 115 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 VNN2O95498 520 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 EMX2Q04743 252 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 OR6N2Q8NGY6 317 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ACOT12Q8WYK0 555 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 IGSF8Q969P0 613 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PTCHD1Q96NR3 888 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 CD320Q9NPF0 282 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 HPF1Q9NWY4 346 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM225Q6GV28 225 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 BORCS8Q96FH0 119 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 RAD9AQ99638 391 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SYNGR4O95473 234 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 S100A1P23297 94 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 CD83Q01151 205 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC12Q96GR4 267 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 MCHR1Q99705 422 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FXYD6Q9H0Q3 95 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD9Q7L273 389 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SLCO2A1Q92959 643 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TSGA13Q96PP4 275 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 REEP4Q9H6H4 257 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NLGN3Q9NZ94 848 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PHLPP1O60346 1717 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 INCA1Q0VD86 236 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R9Q9NYW1 312 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SHPRHQ149N8 1683 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ACRV1P26436 265 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PMS2P3Q13401 168 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN4O14817 238 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 HCRTR2O43614 444 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 RAB39AQ14964 217 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF283Q8N7M2 679 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TCEANCQ8N8B7 351 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM41AQ96HV5 264 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SRCP12931 536 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FBLP22087 321 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 BNIP3Q12983 259 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM165Q9HC07 324 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 RNF186Q9NXI6 227 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ASGR2P07307 311 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 UQCRC2P22695 453 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ENTPD1P49961 510 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 MECP2P51608 486 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms