RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TTC23LQ6PF05 361 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 RPTNQ6XPR3 784 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
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HOXD8-202ENST00000429017 KIRREL1Q96J84 757 aa6.17□□□□□ -1.42
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HOXD8-202ENST00000429017 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.17□□□□□ -1.42
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HOXD8-202ENST00000429017 MED13LQ71F56 2210 aa6.16□□□□□ -1.42
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HOXD8-202ENST00000429017 E7ENX8 843 aa6.16□□□□□ -1.42
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HOXD8-202ENST00000429017 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 FAM227AF5H4B4 570 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 DYNC1I1O14576 645 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 KPNA5O15131 536 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJB6O75190 326 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 VPS26AO75436 327 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 VAPBO95292 243 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CLDN14O95500 239 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SLC16A8O95907 504 aa6.16□□□□□ -1.42
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