RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	STB4	P50104	949 aa		2.63	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	EXG2	P52911	562 aa		2.63	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	TIM44	Q01852	431 aa		2.63	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	TMN2	Q04562	672 aa		2.63	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	THI13	Q07748	340 aa		2.63	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	YOL073C	Q08232	322 aa		2.63	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	MXR1	P40029	184 aa		2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	RRT14	P40470	206 aa		2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	CNN1	P43618	361 aa		2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	CHA4	P43634	648 aa		2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.62	□□□□□ -1.99	not detected
snR46	snR46	ADY3	Q07732	790 aa		2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	RLF2	Q12495	606 aa		2.62	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	BI4	P03879	638 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	SEC8	P32855	1065 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	YER158C	P40095	573 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	HFM1	P51979	1187 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	SIW14	P53965	281 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	MRL1	Q06815	381 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	YLR040C	Q07988	224 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	ACM1	Q08981	209 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	ACF2	Q12168	779 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	OSW2	Q12202	724 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	KCS1	Q12494	1050 aa		2.61	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	MET4	P32389	672 aa		2.6	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	MCM7	P38132	845 aa		2.6	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	IRC10	Q08118	586 aa		2.6	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	MCD1	Q12158	566 aa		2.6	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	PEX2	P32800	271 aa		2.59	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	KTR4	P38131	464 aa		2.59	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	GEM1	P39722	662 aa		2.59	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	YGR012W	P53206	393 aa		2.59	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	ENB1	Q08299	606 aa		2.59	□□□□□ -1.99
snR46	snR46	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
snR46	snR46	SPC42	P36094	363 aa		2.58	□□□□□ -2
snR46	snR46	ENT3	P47160	408 aa		2.58	□□□□□ -2
snR46	snR46	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
snR46	snR46	OMS1	Q06668	471 aa		2.58	□□□□□ -2
snR46	snR46	NPC2	Q12408	173 aa		2.58	□□□□□ -2
snR46	snR46	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
snR46	snR46	ERG4	P25340	473 aa		2.57	□□□□□ -2
snR46	snR46	CCC2	P38995	1004 aa		2.57	□□□□□ -2
snR46	snR46	XYL2	Q07993	356 aa		2.57	□□□□□ -2
snR46	snR46	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
snR46	snR46	KAR4	P25583	335 aa		2.56	□□□□□ -2
snR46	snR46	RAD27	P26793	382 aa		2.56	□□□□□ -2
snR46	snR46	MTH1	P35198	433 aa		2.56	□□□□□ -2
snR46	snR46	MPH1	P40562	993 aa		2.56	□□□□□ -2
snR46	snR46	GND2	P53319	492 aa		2.56	□□□□□ -2
snR46	snR46	RNT1	Q02555	471 aa		2.56	□□□□□ -2
snR46	snR46	GNT1	Q12096	491 aa		2.56	□□□□□ -2
snR46	snR46	NDJ1	Q12366	352 aa		2.56	□□□□□ -2
snR46	snR46	SPE1	P08432	466 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	SRP101	P32916	621 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	SLA2	P33338	968 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	GEF1	P37020	779 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	YAP1801	P38856	637 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	HXT13	P39924	564 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	HXT17	P53631	564 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	HXT15	P54854	567 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	AFT2	Q08957	416 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	LAS17	Q12446	633 aa		2.55	□□□□□ -2
snR46	snR46	GCR1	P07261	785 aa		2.54	□□□□□ -2
snR46	snR46	ALG7	P07286	448 aa		2.54	□□□□□ -2
snR46	snR46	HSF1	P10961	833 aa		2.54	□□□□□ -2
snR46	snR46	PPX1	P38698	397 aa		2.54	□□□□□ -2
snR46	snR46	NCS6	P53088	359 aa		2.54	□□□□□ -2
snR46	snR46	YGR122W	P53272	402 aa		2.54	□□□□□ -2
snR46	snR46	MUK1	Q02866	612 aa		2.54	□□□□□ -2
snR46	snR46	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
snR46	snR46	GUP2	Q08929	609 aa		2.54	□□□□□ -2
snR46	snR46	RAD2	P07276	1031 aa		2.53	□□□□□ -2
snR46	snR46	ATG19	P35193	415 aa		2.53	□□□□□ -2
snR46	snR46	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
snR46	snR46	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
snR46	snR46	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
snR46	snR46	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
snR46	snR46	YAP7	Q08182	245 aa		2.53	□□□□□ -2
snR46	snR46	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	MDM10	P18409	493 aa		2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	PPZ2	P33329	710 aa		2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	RER2	P35196	286 aa		2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	PNT1	P38969	423 aa		2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	MTC3	P53077	123 aa		2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	HOF1	Q05080	669 aa		2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	CDA1	Q06702	301 aa		2.52	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
snR46	snR46	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 1189.4 ms