RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W ARP1P38696 384 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W UME6P39001 836 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W TPM2P40414 161 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W VMA13P41807 478 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W POL32P47110 350 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W AZR1P50080 613 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W GAS4Q08271 471 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W DPB3P27344 201 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RNH70P53331 553 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W ALD6P54115 500 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MOT3P54785 490 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YOR352WQ08816 343 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YBL113CQ7M4S9 792 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MBR1P23493 339 aa3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W VPS64Q03944 604 aa3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YOL098CQ12496 1037 aa3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W ARG82P07250 355 aa3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W KRE2P27809 442 aa3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W CRP1P38845 465 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PAC1P39946 494 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W CLC1P17891 233 aa3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W NGR1P32831 672 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W TCD2P36101 447 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RTS1P38903 757 aa3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PTC2P39966 464 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YNL108CP53929 270 aa3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W KAR5Q04746 504 aa3.36□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PDC6P26263 563 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MDL2P33311 773 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YGL081WP53156 320 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W ESC8Q08119 714 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W TRM11Q12463 433 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W TSR4P25040 408 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W GPI10P30777 616 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W GAC1P28006 793 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W SEA4P38164 1038 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W DSS1P39112 969 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RPN3P40016 523 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W CST6P40535 587 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W CHS6P40955 746 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W GDE1Q02979 1223 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YGR161W-CQ3E744 92 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MAS1P10507 462 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W CLN2P20438 545 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W HXT16P47185 567 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W UBP16Q02863 499 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W HRD3Q05787 833 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W FLO1P32768 1537 aa3.35□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W SRM1P21827 482 aa3.34□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W THI6P41835 540 aa3.34□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YLR455WQ06188 304 aa3.34□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PPM2Q08282 695 aa3.34□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RAD3P06839 778 aa3.34□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W SNF5P18480 905 aa3.34□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W BNI4P53858 892 aa3.34□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MGM1P32266 881 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SPT23P35210 1082 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W GIP1P38229 639 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YJL049WP47048 450 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SLD5Q03406 294 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ARG8P18544 423 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KAR4P25583 335 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PEX2P32800 271 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MTG2P38860 518 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YHR202WP38887 602 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ATG3P40344 310 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YLR001CQ07895 862 aa3.34□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TOM70P07213 617 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W GRX7P38068 203 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W HXT17P53631 564 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UBX5Q06682 500 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MMP1Q12372 583 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RAD27P26793 382 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W GDH3P39708 457 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W EPS1P40557 701 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BIR1P47134 954 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W GAD1Q04792 585 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W POX1P13711 748 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CCC2P38995 1004 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YJL045WP47052 634 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CWC24P53769 259 aa3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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