RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	ROD1	Q02805	837 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	INO1	P11986	533 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SPO16	P17122	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SFL1	P20134	766 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	AEP2	P22136	580 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SGM1	P47166	707 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SPC29	P33419	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YKL133C	P36066	463 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YBR284W	P38150	797 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	GTT3	P39996	337 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SUM1	P46676	1062 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YNL058C	P53947	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	WTM2	Q12206	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RPC31	P17890	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SAN1	P22470	610 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RIM11	P38615	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	DYS1	P38791	387 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RRN7	P40992	514 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	ARA2	Q04212	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	BRF1	P29056	596 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	MLF3	P32047	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RAD18	P10862	487 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	STE6	P12866	1290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	MET8	P15807	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	IRE1	P32361	1115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RXT2	P38255	430 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	AFR1	P33304	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	CKB2	P38930	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	CAJ1	P39101	391 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	TMA108	P40462	946 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	CAF120	P53836	1060 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	TAF11	Q04226	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	OPY2	Q06810	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PET10	P36139	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YGL176C	P46945	554 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	JIP4	Q03361	876 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	NSE5	Q03718	556 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	CDC45	Q08032	650 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	TAF2	P23255	1407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	MSH3	P25336	1018 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PPH3	P32345	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	DPH2	P32461	534 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	YEL1	P34225	687 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	BIT2	P38346	545 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	BI4	P03879	638 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	MSM1	P22438	575 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	AAD3	P25612	363 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SCT1	P32784	759 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	ERT1	P38140	529 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RSM26	P47141	266 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	ECM9	Q02202	377 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	TLG1	Q03322	224 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	SPS1	P08458	490 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	AAC3	P18238	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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