RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HCA4	YJL033W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	MYO4	P32492	1471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	PRI2	P20457	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	PIK1	P39104	1066 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	YGL176C	P46945	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
HCA4	YJL033W	RSC58	Q07979	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	SNF5	P18480	905 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	SEA4	P38164	1038 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	SPP41	P38904	1435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	ORC3	P54790	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	SHE9	Q04172	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	RSB1	Q08417	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	AIM26	P32858	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	ESC2	Q06340	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	HSP78	P33416	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	YKL069W	P36088	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	PNT1	P38969	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	GEM1	P39722	662 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	TSC11	P40061	1430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	MLP2	P40457	1679 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	ACM1	Q08981	209 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HCA4	YJL033W	SPS1	P08458	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	VBA5	P36172	582 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	MXR1	P40029	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	MRP8	P35719	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	ENV11	P53246	860 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	PAN1	P32521	1480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	UGA2	P38067	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	YFL054C	P43549	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	IRR1	P40541	1150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	YJL049W	P47048	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	NNF1	P47149	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	SLA2	P33338	968 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	PBY1	P38254	753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	DFG16	Q99234	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	VTH1	P40438	1549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	VTH2	P40890	1549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	MBP1	P39678	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
HCA4	YJL033W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	ATG13	Q06628	738 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	ECL1	P48235	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	SPT7	P35177	1332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	VPS15	P22219	1454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	RFC5	P38251	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	SVS1	Q12254	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	YBR184W	P38299	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	RRT14	P40470	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	STE5	P32917	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	LRG1	P35688	1017 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	SPO75	Q07798	868 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCA4	YJL033W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HCA4	YJL033W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HCA4	YJL033W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HCA4	YJL033W	BI4	P03879	638 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HCA4	YJL033W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HCA4	YJL033W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCA4	YJL033W	ACE2	P21192	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCA4	YJL033W	TAT2	P38967	592 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCA4	YJL033W	RSM24	Q03976	319 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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