RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	INO1	P11986	533 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	SRM1	P21827	482 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	CTS1	P29029	562 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	LYP1	P32487	611 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.8	□□□□□ -1.32	not detected
SLX1	YBR228W	BI4	P03879	638 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	TAT2	P38967	592 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.79	□□□□□ -1.32	not detected
SLX1	YBR228W	TYW3	P53177	273 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	RXT3	Q07458	294 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	CDC34	P14682	295 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	DUT1	P33317	147 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	GPB1	Q08886	897 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	ATG2	P53855	1592 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SLX1	YBR228W	EEB1	Q02891	456 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	DUS4	Q06063	367 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	SSK2	P53599	1579 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	ACE2	P21192	770 aa		6.76	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	YKL107W	P34251	309 aa		6.76	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	GEM1	P39722	662 aa		6.76	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	ATG13	Q06628	738 aa		6.76	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	6.76	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	PEP1	P32319	1579 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	MDS3	P53094	1487 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	SLA2	P33338	968 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	YGL176C	P46945	554 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	GCV2	P49095	1034 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	SPO20	Q04359	397 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	PNT1	P38969	423 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	YAP6	Q03935	383 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	SIZ1	Q04195	904 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	TMA10	Q06177	86 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	YPL066W	Q12194	479 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	RKM4	Q12504	494 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	ESP1	Q03018	1630 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	CDC20	P26309	610 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	DOM34	P33309	386 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	RRT14	P40470	206 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	HFM1	P51979	1187 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	MSC2	Q03455	724 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	MNR2	P35724	969 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	MET10	P39692	1035 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	TAF2	P23255	1407 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SLX1	YBR228W	ENA1	P13587	1091 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	ENA2	Q01896	1091 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	ENA5	Q12691	1091 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	EMC1	P25574	760 aa		6.7	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	ESC2	Q06340	456 aa		6.7	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	CDC6	P09119	513 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	GDE1	Q02979	1223 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	LST4	P34239	828 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	ZRG8	P40021	1076 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	XYL2	Q07993	356 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	MND2	P40577	368 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	VPS62	P53285	467 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	HMI1	Q12039	706 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	OSW2	Q12202	724 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	HCM1	P25364	564 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	POA1	P38218	177 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	MAD1	P40957	749 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	CWC24	P53769	259 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	YLR224W	Q05947	369 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	TPO1	Q07824	586 aa		6.65	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
SLX1	YBR228W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	CLN2	P20438	545 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	STE11	P23561	717 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	YGR053C	P53234	283 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	HRQ1	Q05549	1077 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	TRM2	P33753	639 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.63	□□□□□ -1.35	not detected
SLX1	YBR228W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	MTC3	P53077	123 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	YAP1801	P38856	637 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	MDM38	Q08179	573 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	PNS1	Q12412	539 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	SRP101	P32916	621 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	PLB1	P39105	664 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	YGR012W	P53206	393 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	YKL151C	P36059	337 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	PHO23	P50947	330 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	YPK9	Q12697	1472 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SLX1	YBR228W	MBP1	P39678	833 aa		6.59	□□□□□ -1.35

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