RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-223	ENST00000584229	IL16	Q14005	1332 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	SSFA2	P28290	1259 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	RPS6KA4	O75676	772 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.36	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	A1BG	P04217	495 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	COL15A1	P39059	1388 aa		32.32	■■■□□ 2.77
GPS1-223	ENST00000584229	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.31	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	RFC4	P35249	363 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	ARX	Q96QS3	562 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	ADRA2B	P18089	450 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
GPS1-223	ENST00000584229	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	SCN7A	Q01118	1682 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	MYL6B	P14649	208 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	ZPR1	O75312	459 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	HOXB7	P09629	217 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	LRP5	O75197	1615 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087WZG4	1122 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229		E9PSI1	815 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.2	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.2	■■■□□ 2.75
GPS1-223	ENST00000584229	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.2	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	ANXA1	P04083	346 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	POLD1	P28340	1107 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	SLFN5	Q08AF3	891 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	GYS1	P13807	737 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	NUP98	P52948	1817 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GPS1-223	ENST00000584229	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	PDIA6	Q15084	440 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	FKBP8	Q14318	412 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	PTGER2	P43116	358 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GPS1-223	ENST00000584229	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.07	■■■□□ 2.72

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