RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 MBIPQ9NS73 344 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 WDR63Q8IWG1 891 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 RPS6KA4O75676 772 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 PHF14O94880 888 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 IL16Q14005 1332 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-208ENST00000566059 SSFA2P28290 1259 aa23.33■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 KRT24Q2M2I5 525 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF521Q96K83 1311 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 A1BGP04217 495 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 CASZ1Q86V15 1759 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 MSH5O43196 834 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 ZBTB7AO95365 584 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 ADRA2BP18089 450 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-208ENST00000566059 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF26B4DH59 902 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF15Q8N660 670 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 MTFR1LQ9H019 292 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 RFC4P35249 363 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 COL15A1P39059 1388 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 HOXB7P09629 217 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 GOLGA2Q08379 1002 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 SPON1Q9HCB6 807 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 TSPYL6Q8N831 410 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 NECTIN2Q92692 538 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-208ENST00000566059 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 MSL1Q68DK7 614 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 PDIA6Q15084 440 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 ERBB4Q15303 1308 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 GYS1P13807 737 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 PTGER2P43116 358 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 C4AP0C0L4 1744 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 A0A087WZG4 1122 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 MYL6BP14649 208 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 NARFQ9UHQ1 456 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 E9PSI1 815 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 SLFN5Q08AF3 891 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 ZPR1O75312 459 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 PROSER3Q2NL68 480 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 ANXA1P04083 346 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 ARXQ96QS3 562 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-208ENST00000566059 FKBP8Q14318 412 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 CAMTA2O94983 1202 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 LRP5O75197 1615 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 VAMP4O75379 141 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 POLD1P28340 1107 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 MMP10P09238 476 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 TM4SF1P30408 202 aa23.08■■□□□ 1.29
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