RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.08■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LAMB4A4D0S4 1761 aa29.06■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.05■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLD1P28340 1107 aa29.04■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa29.04■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RFC4P35249 363 aa29.02■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MSL1Q68DK7 614 aa29.02■■■□□ 2.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL15A1P39059 1388 aa29.01■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM9BQ8IZU0 186 aa29■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCER2I3L3R5 266 aa28.99■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARXQ96QS3 562 aa28.99■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP16Q9Y5T5 823 aa28.99■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.98■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHL1O00533 1208 aa28.98■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC27Q2M243 656 aa28.98■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFAP44Q96MT7 982 aa28.96■■■□□ 2.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A1BGP04217 495 aa28.95■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A087WZG4 1122 aa28.94■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GYS1P13807 737 aa28.94■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.94■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFT57Q9NWB7 429 aa28.93■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.92■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZPR1O75312 459 aa28.92■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NARFQ9UHQ1 456 aa28.92■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCN7AQ01118 1682 aa28.91■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF853P0CG23 659 aa28.91■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GNAI1P63096 354 aa28.91■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WWC1Q8IX03 1113 aa28.9■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NGEFQ8N5V2 710 aa28.89■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MMP10P09238 476 aa28.88■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.88■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MBIPQ9NS73 344 aa28.88■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.87■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF26B4DH59 902 aa28.87■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF15Q8N660 670 aa28.87■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERBB4Q15303 1308 aa28.87■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FKBP8Q14318 412 aa28.86■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCORQ6W2J9 1755 aa28.85■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYT17Q9BSW7 474 aa28.85■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL16Q14005 1332 aa28.85■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HOXB7P09629 217 aa28.84■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLHL34Q8N239 644 aa28.83■■■□□ 2.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.82■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.82■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT24Q2M2I5 525 aa28.81■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.81■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR63Q8IWG1 891 aa28.8■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MIER1Q8N108 512 aa28.8■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CAMTA2O94983 1202 aa28.79■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.79■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TM4SF1P30408 202 aa28.78■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGL2O15211 777 aa28.77■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDR1Q08345 913 aa28.77■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.77■■■□□ 2.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.76■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYL6BP14649 208 aa28.76■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NFIXQ14938 502 aa28.76■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.76■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.75■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.75■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDIA6Q15084 440 aa28.74■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.74■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.74■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NECTIN2Q92692 538 aa28.73■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.72■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.72■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.72■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.72■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.7■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF521Q96K83 1311 aa28.7■■■□□ 2.19
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.7■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PROSER3Q2NL68 480 aa28.7■■■□□ 2.18
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.7■■■□□ 2.18
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