RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
USP3-AS1-209ENST00000561191 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.34■■□□□ 1.49
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.34■■□□□ 1.49
USP3-AS1-209ENST00000561191 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.33■■□□□ 1.49
USP3-AS1-209ENST00000561191 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCER2I3L3R5 266 aa24.32■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADRA2BP18089 450 aa24.32■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 STARD3NLO95772 234 aa24.31■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 MSL1Q68DK7 614 aa24.31■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.31■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 SCN7AQ01118 1682 aa24.3■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 COL15A1P39059 1388 aa24.29■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHL1O00533 1208 aa24.29■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.29■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP16Q9Y5T5 823 aa24.29■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC27Q2M243 656 aa24.28■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 MIER1Q8N108 512 aa24.28■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 BCORQ6W2J9 1755 aa24.27■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 A1BGP04217 495 aa24.27■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF853P0CG23 659 aa24.26■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 CFAP44Q96MT7 982 aa24.26■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 WWC1Q8IX03 1113 aa24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 RFC4P35249 363 aa24.24■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 IFT57Q9NWB7 429 aa24.24■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRT24Q2M2I5 525 aa24.23■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 MBIPQ9NS73 344 aa24.23■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 GYS1P13807 737 aa24.22■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 NBPF26B4DH59 902 aa24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 NBPF15Q8N660 670 aa24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-209ENST00000561191 POLD1P28340 1107 aa24.2■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 GNAI1P63096 354 aa24.2■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARXQ96QS3 562 aa24.2■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 NARFQ9UHQ1 456 aa24.18■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 FKBP8Q14318 412 aa24.17■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.17■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 IL16Q14005 1332 aa24.16■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.16■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.16■■□□□ 1.46
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USP3-AS1-209ENST00000561191 MMP10P09238 476 aa24.15■■□□□ 1.46
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USP3-AS1-209ENST00000561191 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF521Q96K83 1311 aa24.14■■□□□ 1.46
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USP3-AS1-209ENST00000561191 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.14■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 ERBB4Q15303 1308 aa24.13■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.13■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 CAMTA2O94983 1202 aa24.12■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 HOXB7P09629 217 aa24.12■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.12■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 WDR63Q8IWG1 891 aa24.12■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.12■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDR1Q08345 913 aa24.11■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 PDIA6Q15084 440 aa24.11■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 PROSER3Q2NL68 480 aa24.11■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.11■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 NECTIN2Q92692 538 aa24.11■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 NUP98P52948 1817 aa24.11■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.1■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.1■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANXA1P04083 346 aa24.09■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYL6BP14649 208 aa24.09■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 SYT17Q9BSW7 474 aa24.09■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.09■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 TM4SF1P30408 202 aa24.08■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 NFIXQ14938 502 aa24.08■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.08■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 KLHL34Q8N239 644 aa24.08■■□□□ 1.45
USP3-AS1-209ENST00000561191 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-209ENST00000561191 TSPYL6Q8N831 410 aa24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-209ENST00000561191 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
USP3-AS1-209ENST00000561191 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.06■■□□□ 1.44
USP3-AS1-209ENST00000561191 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.06■■□□□ 1.44
USP3-AS1-209ENST00000561191 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.06■■□□□ 1.44
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