RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-208ENST00000558954 MTFR1LQ9H019 292 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-208ENST00000558954 RPS6KA4O75676 772 aa24.65■■□□□ 1.54
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB7AO95365 584 aa24.65■■□□□ 1.54
RABGGTA-208ENST00000558954 SPON1Q9HCB6 807 aa24.65■■□□□ 1.54
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
RABGGTA-208ENST00000558954 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
RABGGTA-208ENST00000558954 NGEFQ8N5V2 710 aa24.64■■□□□ 1.54
RABGGTA-208ENST00000558954 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
RABGGTA-208ENST00000558954 SCN7AQ01118 1682 aa24.64■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 BCORQ6W2J9 1755 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 CHL1O00533 1208 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 CFAP44Q96MT7 982 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 IFT57Q9NWB7 429 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 WWC1Q8IX03 1113 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 COL15A1P39059 1388 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 GNAI1P63096 354 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 SMIM5Q71RC9 77 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF853P0CG23 659 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 RFC4P35249 363 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 USP16Q9Y5T5 823 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-208ENST00000558954 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 MBIPQ9NS73 344 aa24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 IL16Q14005 1332 aa24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 PTGER2P43116 358 aa24.55■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 A1BGP04217 495 aa24.54■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 POLD1P28340 1107 aa24.54■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 MSL1Q68DK7 614 aa24.54■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 CACNA1FO60840 1977 aa24.54■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR63Q8IWG1 891 aa24.53■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.53■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 NUP98P52948 1817 aa24.52■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A087WZG4 1122 aa24.52■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
RABGGTA-208ENST00000558954 ZPR1O75312 459 aa24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 HOXB7P09629 217 aa24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 ERBB4Q15303 1308 aa24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 GYS1P13807 737 aa24.49■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT24Q2M2I5 525 aa24.49■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 NARFQ9UHQ1 456 aa24.49■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.49■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF26B4DH59 902 aa24.48■■□□□ 1.51
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RABGGTA-208ENST00000558954 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.48■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF15Q8N660 670 aa24.48■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.47■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF521Q96K83 1311 aa24.47■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.46■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.46■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 ARXQ96QS3 562 aa24.46■■□□□ 1.51
RABGGTA-208ENST00000558954 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.45■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.44■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.44■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.44■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.44■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 MMP10P09238 476 aa24.43■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 MYL6BP14649 208 aa24.42■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 FKBP8Q14318 412 aa24.42■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.42■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.41■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 NECTIN2Q92692 538 aa24.41■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.41■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 CAMTA2O94983 1202 aa24.4■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 GOLGA2Q08379 1002 aa24.4■■□□□ 1.5
RABGGTA-208ENST00000558954 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 PDIA6Q15084 440 aa24.39■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.39■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.39■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.39■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 RGL2O15211 777 aa24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 PROSER3Q2NL68 480 aa24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.37■■□□□ 1.49
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