RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	C4A	P0C0L4	1744 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	RFC4	P35249	363 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	ARX	Q96QS3	562 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	APAF1	O14727	1248 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRK-222	ENST00000532751	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PTPRK-222	ENST00000532751	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRK-222	ENST00000532751	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PTPRK-222	ENST00000532751	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPRK-222	ENST00000532751	COL15A1	P39059	1388 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PTPRK-222	ENST00000532751	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
PTPRK-222	ENST00000532751	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPRK-222	ENST00000532751	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PTPRK-222	ENST00000532751	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PTPRK-222	ENST00000532751	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	ZPR1	O75312	459 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751		A0A087WZG4	1122 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	A1BG	P04217	495 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	GYS1	P13807	737 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	CHL1	O00533	1208 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PTPRK-222	ENST00000532751	MMP10	P09238	476 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC27	Q2M243	656 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	GNAI1	P63096	354 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	FKBP8	Q14318	412 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	IFT57	Q9NWB7	429 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	CCER2	I3L3R5	266 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PTPRK-222	ENST00000532751	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF853	P0CG23	659 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	NBPF26	B4DH59	902 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	ERBB4	Q15303	1308 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	NBPF15	Q8N660	670 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	WWC1	Q8IX03	1113 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	TM4SF1	P30408	202 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	HOXB7	P09629	217 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PTPRK-222	ENST00000532751	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	MYL6B	P14649	208 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	DDR1	Q08345	913 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	NFIX	Q14938	502 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	IL16	Q14005	1332 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	WDR63	Q8IWG1	891 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	RGL2	O15211	777 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PTPRK-222	ENST00000532751	SERPINB2	P05120	415 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	SETDB2	Q96T68	719 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	NUP98	P52948	1817 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	TGFB2	P61812	414 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	PDIA6	Q15084	440 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PTPRK-222	ENST00000532751	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14

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