RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 STARD3NLO95772 234 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 MSL1Q68DK7 614 aa24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 POLD1P28340 1107 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-208ENST00000531226 COL15A1P39059 1388 aa24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 SCN7AQ01118 1682 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 RFC4P35249 363 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 USP16Q9Y5T5 823 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 BCORQ6W2J9 1755 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 CCER2I3L3R5 266 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 CHL1O00533 1208 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 ARXQ96QS3 562 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC27Q2M243 656 aa24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 A1BGP04217 495 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 GYS1P13807 737 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 CFAP44Q96MT7 982 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-208ENST00000531226 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF853P0CG23 659 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 IFT57Q9NWB7 429 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A087WZG4 1122 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 NARFQ9UHQ1 456 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 ZPR1O75312 459 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 WWC1Q8IX03 1113 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 GNAI1P63096 354 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 MBIPQ9NS73 344 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF26B4DH59 902 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF15Q8N660 670 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-208ENST00000531226 MMP10P09238 476 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 FKBP8Q14318 412 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 NUP98P52948 1817 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 SYT17Q9BSW7 474 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 ERBB4Q15303 1308 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT24Q2M2I5 525 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 NGEFQ8N5V2 710 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 IL16Q14005 1332 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 MIER1Q8N108 512 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 KLHL34Q8N239 644 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXB7P09629 217 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-208ENST00000531226 CAMTA2O94983 1202 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 TM4SF1P30408 202 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 DDR1Q08345 913 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR63Q8IWG1 891 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 NFIXQ14938 502 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 MYL6BP14649 208 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 PDIA6Q15084 440 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 CACNA1FO60840 1977 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 NECTIN2Q92692 538 aa24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 RGL2O15211 777 aa24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF521Q96K83 1311 aa24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 PROSER3Q2NL68 480 aa24.63■■□□□ 1.53
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