RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527103.1

PITPNM1-208, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1, human

TSL 4

Gene PITPNM1, Length 308 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITPNM1-208	ENST00000527103	RFC4	P35249	363 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PITPNM1-208	ENST00000527103	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PITPNM1-208	ENST00000527103	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PITPNM1-208	ENST00000527103	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PITPNM1-208	ENST00000527103	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PITPNM1-208	ENST00000527103	USP16	Q9Y5T5	823 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	A1BG	P04217	495 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PITPNM1-208	ENST00000527103	GYS1	P13807	737 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZPR1	O75312	459 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	KLHL34	Q8N239	644 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	CHL1	O00533	1208 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	NARF	Q9UHQ1	456 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	COL15A1	P39059	1388 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103		A0A087WZG4	1122 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	MMP10	P09238	476 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PITPNM1-208	ENST00000527103	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	FKBP8	Q14318	412 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	CFAP44	Q96MT7	982 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	NBPF26	B4DH59	902 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	NBPF15	Q8N660	670 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	CCDC27	Q2M243	656 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	C4A	P0C0L4	1744 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF853	P0CG23	659 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	TM4SF1	P30408	202 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	IFT57	Q9NWB7	429 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	GNAI1	P63096	354 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	MBIP	Q9NS73	344 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	WWC1	Q8IX03	1113 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	KRT24	Q2M2I5	525 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	CCER2	I3L3R5	266 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	DDR1	Q08345	913 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	NFIX	Q14938	502 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PITPNM1-208	ENST00000527103	CAMTA2	O94983	1202 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	NGEF	Q8N5V2	710 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	MYL6B	P14649	208 aa		29	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	ERBB4	Q15303	1308 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	PDIA6	Q15084	440 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PITPNM1-208	ENST00000527103	SERPINB2	P05120	415 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	HOXB7	P09629	217 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	WDR63	Q8IWG1	891 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	IL16	Q14005	1332 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	TGFB2	P61812	414 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	GPR162	Q16538	588 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	SETDB2	Q96T68	719 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	RGL2	O15211	777 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	ANXA1	P04083	346 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	HLF	Q16534	295 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	PROSER3	Q2NL68	480 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	MIER1	Q8N108	512 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PITPNM1-208	ENST00000527103	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.9	■■■□□ 2.22

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