RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514050.6

RASGEF1B-211, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-211ENST00000514050 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
RASGEF1B-211ENST00000514050 POLD1P28340 1107 aa31.64■■■□□ 2.66
RASGEF1B-211ENST00000514050 TSPYL4Q9UJ04 414 aa31.64■■■□□ 2.66
RASGEF1B-211ENST00000514050 RFC4P35249 363 aa31.62■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa31.62■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 MSL1Q68DK7 614 aa31.61■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 FAM9BQ8IZU0 186 aa31.61■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 USP16Q9Y5T5 823 aa31.61■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 CANXP27824 592 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 ARXQ96QS3 562 aa31.59■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa31.58■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 CHL1O00533 1208 aa31.58■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
RASGEF1B-211ENST00000514050 CCER2I3L3R5 266 aa31.56■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 KDM3BQ7LBC6 1761 aa31.56■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 A1BGP04217 495 aa31.55■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 CCDC27Q2M243 656 aa31.55■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 CFAP44Q96MT7 982 aa31.55■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 EIF5P55010 431 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 NLGN1Q8N2Q7 840 aa31.54■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 COL15A1P39059 1388 aa31.54■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 COL24A1Q17RW2 1714 aa31.53■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 GYS1P13807 737 aa31.53■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 A0A087WZG4 1122 aa31.52■■■□□ 2.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 ZPR1O75312 459 aa31.51■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 IFT57Q9NWB7 429 aa31.5■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 NARFQ9UHQ1 456 aa31.5■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.49■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 ZNF853P0CG23 659 aa31.49■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 GNAI1P63096 354 aa31.48■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 WWC1Q8IX03 1113 aa31.48■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 USPL1Q5W0Q7 1092 aa31.47■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 MBIPQ9NS73 344 aa31.46■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 MMP10P09238 476 aa31.45■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 NGEFQ8N5V2 710 aa31.45■■■□□ 2.63
RASGEF1B-211ENST00000514050 C4AP0C0L4 1744 aa31.44■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 NBPF26B4DH59 902 aa31.44■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 FKBP8Q14318 412 aa31.44■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 NBPF15Q8N660 670 aa31.44■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 SYT17Q9BSW7 474 aa31.44■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa31.41■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 MIER1Q8N108 512 aa31.4■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 KLHL34Q8N239 644 aa31.4■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 ERBB4Q15303 1308 aa31.4■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 HOXB7P09629 217 aa31.39■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 KRT24Q2M2I5 525 aa31.39■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 BCL2L12Q9HB09 334 aa31.39■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 PARP3Q9Y6F1 533 aa31.39■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 IL16Q14005 1332 aa31.39■■■□□ 2.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 LAMB4A4D0S4 1761 aa31.38■■■□□ 2.61
RASGEF1B-211ENST00000514050 WDR63Q8IWG1 891 aa31.38■■■□□ 2.61
RASGEF1B-211ENST00000514050 TM4SF1P30408 202 aa31.37■■■□□ 2.61
RASGEF1B-211ENST00000514050 CD2APQ9Y5K6 639 aa31.37■■■□□ 2.61
RASGEF1B-211ENST00000514050 CAMTA2O94983 1202 aa31.36■■■□□ 2.61
RASGEF1B-211ENST00000514050 MYL6BP14649 208 aa31.34■■■□□ 2.61
RASGEF1B-211ENST00000514050 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.34■■■□□ 2.61
RASGEF1B-211ENST00000514050 NFIXQ14938 502 aa31.33■■■□□ 2.61
RASGEF1B-211ENST00000514050 DDR1Q08345 913 aa31.32■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 PDIA6Q15084 440 aa31.32■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 RGL2O15211 777 aa31.31■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa31.31■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 CLEC4GQ6UXB4 293 aa31.31■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 NECTIN2Q92692 538 aa31.31■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 ZNF652Q9Y2D9 606 aa31.3■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 TBC1D9BQ66K14 1250 aa31.29■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 NLGN2Q8NFZ4 835 aa31.29■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 KIF6Q6ZMV9 814 aa31.27■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 BICDL1Q6ZP65 573 aa31.27■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.27■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 C8orf58Q8NAV2 365 aa31.27■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 SCN7AQ01118 1682 aa31.26■■■□□ 2.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 ERVV-1B6SEH8 477 aa31.26■■■□□ 2.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 PROSER3Q2NL68 480 aa31.26■■■□□ 2.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 CHMP4AQ9BY43 222 aa31.26■■■□□ 2.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 DCAF8L1A6NGE4 600 aa31.25■■■□□ 2.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.25■■■□□ 2.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 SETDB2Q96T68 719 aa31.25■■■□□ 2.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms