RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 GNAI1P63096 354 aa21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 RPS6KA4O75676 772 aa21.63■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.63■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 SCN7AQ01118 1682 aa21.63■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 STARD3NLO95772 234 aa21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 HOXB7P09629 217 aa21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 MBIPQ9NS73 344 aa21.62■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 BCORQ6W2J9 1755 aa21.61■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 GNPATO15228 680 aa21.61■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 ERBB4Q15303 1308 aa21.59■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.59■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 USP16Q9Y5T5 823 aa21.59■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HCLS1-208ENST00000487290 COL15A1P39059 1388 aa21.58■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 MTFR1LQ9H019 292 aa21.57■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.56■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.54■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 CACNA1FO60840 1977 aa21.54■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.54■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 RGL2O15211 777 aa21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 NBPF26B4DH59 902 aa21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 A1BGP04217 495 aa21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 KRT24Q2M2I5 525 aa21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 NBPF15Q8N660 670 aa21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-208ENST00000487290 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.51■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 PHF14O94880 888 aa21.51■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 PTGER2P43116 358 aa21.51■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 A0A087WZG4 1122 aa21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 SMIM5Q71RC9 77 aa21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 SPON1Q9HCB6 807 aa21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 NARFQ9UHQ1 456 aa21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 PDIA6Q15084 440 aa21.49■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.49■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.49■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.49■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 ZBTB7AO95365 584 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 GYS1P13807 737 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 POTEDQ86YR6 584 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 E9PSI1 815 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 RFC4P35249 363 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 GOLGA2Q08379 1002 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.47■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.46■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 NUP98P52948 1817 aa21.45■■□□□ 1.03
HCLS1-208ENST00000487290 SLFN5Q08AF3 891 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 TSPYL6Q8N831 410 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 CAMTA2O94983 1202 aa21.44■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.44■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 MSH5O43196 834 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 PROSER3Q2NL68 480 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 ATP10DQ9P241 1426 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 ZPR1O75312 459 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 VAMP4O75379 141 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 POLD1P28340 1107 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 FKBP8Q14318 412 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-208ENST00000487290 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.39■■□□□ 1.01
HCLS1-208ENST00000487290 TM4SF1P30408 202 aa21.39■■□□□ 1.01
HCLS1-208ENST00000487290 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
HCLS1-208ENST00000487290 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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