RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CNKSR1-208ENST00000484874 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.65■■□□□ 1.38
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF853P0CG23 659 aa23.64■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 WWC1Q8IX03 1113 aa23.64■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 USP16Q9Y5T5 823 aa23.64■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.63■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 ZBTB7AO95365 584 aa23.63■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.63■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 MSH5O43196 834 aa23.62■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 IFT57Q9NWB7 429 aa23.62■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 PHF14O94880 888 aa23.61■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 GNAI1P63096 354 aa23.61■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 SMIM5Q71RC9 77 aa23.61■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.6■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.59■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 A1BGP04217 495 aa23.59■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 RFC4P35249 363 aa23.59■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 PTGER2P43116 358 aa23.59■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 WDR63Q8IWG1 891 aa23.59■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.59■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 IL16Q14005 1332 aa23.59■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CNKSR1-208ENST00000484874 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.57■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 LRP5O75197 1615 aa23.57■■□□□ 1.36
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CNKSR1-208ENST00000484874 MBIPQ9NS73 344 aa23.56■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A087WZG4 1122 aa23.55■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.55■■□□□ 1.36
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CNKSR1-208ENST00000484874 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.53■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 POLD1P28340 1107 aa23.53■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 NARFQ9UHQ1 456 aa23.53■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.52■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 GYS1P13807 737 aa23.52■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 ERBB4Q15303 1308 aa23.52■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 COL15A1P39059 1388 aa23.52■■□□□ 1.36
CNKSR1-208ENST00000484874 NBPF26B4DH59 902 aa23.51■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 ZPR1O75312 459 aa23.51■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 NBPF15Q8N660 670 aa23.51■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 ARXQ96QS3 562 aa23.5■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF521Q96K83 1311 aa23.49■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 KRT24Q2M2I5 525 aa23.48■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 MSL1Q68DK7 614 aa23.48■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.48■■□□□ 1.35
CNKSR1-208ENST00000484874 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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CNKSR1-208ENST00000484874 TM4SF1P30408 202 aa23.45■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 PDIA6Q15084 440 aa23.45■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.45■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 C4AP0C0L4 1744 aa23.45■■□□□ 1.34
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CNKSR1-208ENST00000484874 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.44■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.44■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.44■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 CAMTA2O94983 1202 aa23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 MMP10P09238 476 aa23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 GOLGA2Q08379 1002 aa23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 MYL6BP14649 208 aa23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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CNKSR1-208ENST00000484874 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.39■■□□□ 1.34
CNKSR1-208ENST00000484874 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 TSPYL6Q8N831 410 aa23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 SYT17Q9BSW7 474 aa23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 NECTIN2Q92692 538 aa23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 E9PSI1 815 aa23.37■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 NFIXQ14938 502 aa23.37■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.37■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 HYPKQ9NX55 129 aa23.37■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.37■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CNKSR1-208ENST00000484874 PROSER3Q2NL68 480 aa23.36■■□□□ 1.33
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