RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452514.6

MEG3-211, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MEG3, Length 461 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-211ENST00000452514 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.25■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 SSFA2P28290 1259 aa23.24■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 MBIPQ9NS73 344 aa23.24■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 RPS6KA4O75676 772 aa23.23■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 STARD3NLO95772 234 aa23.23■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 GNAI1P63096 354 aa23.23■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 USP16Q9Y5T5 823 aa23.23■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 IL16Q14005 1332 aa23.23■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 PHF14O94880 888 aa23.22■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.22■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 WDR63Q8IWG1 891 aa23.21■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.21■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 ZNF521Q96K83 1311 aa23.21■■□□□ 1.31
MEG3-211ENST00000452514 C4AP0C0L4 1744 aa23.2■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 ADRA2BP18089 450 aa23.19■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 KRT24Q2M2I5 525 aa23.19■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 A1BGP04217 495 aa23.18■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 MSH5O43196 834 aa23.17■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 ZBTB7AO95365 584 aa23.17■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.17■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 LRP5O75197 1615 aa23.16■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.16■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.16■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 COL15A1P39059 1388 aa23.15■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 MTFR1LQ9H019 292 aa23.15■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
MEG3-211ENST00000452514 NBPF26B4DH59 902 aa23.14■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 NBPF15Q8N660 670 aa23.14■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.13■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 HOXB7P09629 217 aa23.12■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.12■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 SPON1Q9HCB6 807 aa23.12■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 RFC4P35249 363 aa23.11■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.11■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 ERBB4Q15303 1308 aa23.1■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 MSL1Q68DK7 614 aa23.1■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.1■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 PTGER2P43116 358 aa23.09■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 SCN7AQ01118 1682 aa23.09■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 A0A087WZG4 1122 aa23.08■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 GOLGA2Q08379 1002 aa23.08■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 TSPYL6Q8N831 410 aa23.08■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.08■■□□□ 1.29
MEG3-211ENST00000452514 GYS1P13807 737 aa23.07■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 PDIA6Q15084 440 aa23.07■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.07■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 NECTIN2Q92692 538 aa23.07■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 NARFQ9UHQ1 456 aa23.07■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.288e-11■■■□□ 15.1
MEG3-211ENST00000452514 BCORQ6W2J9 1755 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 PROSER3Q2NL68 480 aa23.05■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.05■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.05■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 E9PSI1 815 aa23.04■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 ZPR1O75312 459 aa23.04■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 MYL6BP14649 208 aa23.04■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 SLFN5Q08AF3 891 aa23.04■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.04■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.04■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 ANXA1P04083 346 aa23.03■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.03■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.03■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 CAMTA2O94983 1202 aa23.02■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 FKBP8Q14318 412 aa23.02■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.02■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
MEG3-211ENST00000452514 POLD1P28340 1107 aa23.01■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 ARXQ96QS3 562 aa23■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 MMP10P09238 476 aa22.99■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.99■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.98■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 VAMP4O75379 141 aa22.97■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.97■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.97■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 RGL2O15211 777 aa22.96■■□□□ 1.27
MEG3-211ENST00000452514 TM4SF1P30408 202 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.8 ms