RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 POLD1P28340 1107 aa22.08■■□□□ 1.13
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RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CHL1O00533 1208 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 USP16Q9Y5T5 823 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ARXQ96QS3 562 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CCER2I3L3R5 266 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC27Q2M243 656 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CFAP44Q96MT7 982 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 A1BGP04217 495 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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RABGEF1-204ENST00000442563 A0A087WZG4 1122 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 MSL1Q68DK7 614 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF853P0CG23 659 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GYS1P13807 737 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.01■■□□□ 1.11
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RABGEF1-204ENST00000442563 NGEFQ8N5V2 710 aa22■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 IFT57Q9NWB7 429 aa22■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NARFQ9UHQ1 456 aa22■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 COL15A1P39059 1388 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZPR1O75312 459 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GNAI1P63096 354 aa21.98■■□□□ 1.11
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RABGEF1-204ENST00000442563 WWC1Q8IX03 1113 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SYT17Q9BSW7 474 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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RABGEF1-204ENST00000442563 NBPF26B4DH59 902 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 MMP10P09238 476 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 FKBP8Q14318 412 aa21.95■■□□□ 1.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 MBIPQ9NS73 344 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 ERBB4Q15303 1308 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXB7P09629 217 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 IL16Q14005 1332 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 TM4SF1P30408 202 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR63Q8IWG1 891 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.93■■□□□ 1.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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RABGEF1-204ENST00000442563 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT24Q2M2I5 525 aa21.89■■□□□ 1.09
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RABGEF1-204ENST00000442563 NFIXQ14938 502 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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RABGEF1-204ENST00000442563 DDR1Q08345 913 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 PDIA6Q15084 440 aa21.87■■□□□ 1.09
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RABGEF1-204ENST00000442563 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 MYL6BP14649 208 aa21.85■■□□□ 1.09
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RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.83■■□□□ 1.09
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF521Q96K83 1311 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINB2P05120 415 aa21.82■■□□□ 1.08
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RABGEF1-204ENST00000442563 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SETDB2Q96T68 719 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 PROSER3Q2NL68 480 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.81■■□□□ 1.08
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