RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.71■■□□□ 1.87
CLDN3-201ENST00000395145 MSH5O43196 834 aa26.7■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC27Q2M243 656 aa26.7■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.7■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 C4AP0C0L4 1744 aa26.7■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.69■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 CHL1O00533 1208 aa26.69■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 PTGER2P43116 358 aa26.69■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.69■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.68■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.66■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 CFAP44Q96MT7 982 aa26.66■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 USP16Q9Y5T5 823 aa26.66■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF853P0CG23 659 aa26.64■■□□□ 1.86
CLDN3-201ENST00000395145 WWC1Q8IX03 1113 aa26.63■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 IFT57Q9NWB7 429 aa26.63■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 COL15A1P39059 1388 aa26.62■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 RFC4P35249 363 aa26.62■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 MIER1Q8N108 512 aa26.62■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 NGEFQ8N5V2 710 aa26.62■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 A1BGP04217 495 aa26.61■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 POLD1P28340 1107 aa26.6■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 GNAI1P63096 354 aa26.6■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 MSL1Q68DK7 614 aa26.6■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.59■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 GYS1P13807 737 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 MBIPQ9NS73 344 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 IL16Q14005 1332 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN3-201ENST00000395145 ARXQ96QS3 562 aa26.57■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 A0A087WZG4 1122 aa26.56■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.56■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 NARFQ9UHQ1 456 aa26.56■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 NBPF26B4DH59 902 aa26.55■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 NBPF15Q8N660 670 aa26.55■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 WDR63Q8IWG1 891 aa26.54■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 ERBB4Q15303 1308 aa26.54■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 SCN7AQ01118 1682 aa26.54■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 ZPR1O75312 459 aa26.53■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 HOXB7P09629 217 aa26.53■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 KRT24Q2M2I5 525 aa26.52■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CLDN3-201ENST00000395145 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.51■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 BCORQ6W2J9 1755 aa26.51■■□□□ 1.83
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CLDN3-201ENST00000395145 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 MMP10P09238 476 aa26.49■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 FKBP8Q14318 412 aa26.49■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.49■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF521Q96K83 1311 aa26.48■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.47■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.47■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 CAMTA2O94983 1202 aa26.46■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 PDIA6Q15084 440 aa26.46■■□□□ 1.83
CLDN3-201ENST00000395145 RGL2O15211 777 aa26.45■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 TM4SF1P30408 202 aa26.45■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.45■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 SYT17Q9BSW7 474 aa26.44■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.43■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.43■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.42■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 MYL6BP14649 208 aa26.42■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.42■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 DDR1Q08345 913 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 NFIXQ14938 502 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.41■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 PROSER3Q2NL68 480 aa26.4■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 NECTIN2Q92692 538 aa26.4■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.4■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.39■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 TSPYL6Q8N831 410 aa26.39■■□□□ 1.82
CLDN3-201ENST00000395145 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.38■■□□□ 1.81
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