RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375419.1

C9orf129-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 129, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C9orf129, Length 1,154 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf129-201ENST00000375419 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
C9orf129-201ENST00000375419 KCNQ3O43525 872 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf129-201ENST00000375419 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf129-201ENST00000375419 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
C9orf129-201ENST00000375419 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
C9orf129-201ENST00000375419 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 SMIM5Q71RC9 77 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 C4AP0C0L4 1744 aa25.18■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 RFC4P35249 363 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 COL15A1P39059 1388 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 CHD4Q14839 1912 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 APAF1O14727 1248 aa25.15■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 MSL1Q68DK7 614 aa25.15■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.15■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 NEUROD2Q15784 382 aa25.14■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.14■■□□□ 1.62
C9orf129-201ENST00000375419 GYS1P13807 737 aa25.13■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 KLHL34Q8N239 644 aa25.13■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.13■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.11■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 A0A087WZG4 1122 aa25.11■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 CHL1O00533 1208 aa25.11■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 GPR162Q16538 588 aa25.11■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 USP16Q9Y5T5 823 aa25.11■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 CCDC27Q2M243 656 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 NARFQ9UHQ1 456 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 UTRNP46939 3433 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 CFAP44Q96MT7 982 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf129-201ENST00000375419 ZPR1O75312 459 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 A1BGP04217 495 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 MMP10P09238 476 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 ZNF853P0CG23 659 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 ERBB4Q15303 1308 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 IFT57Q9NWB7 429 aa25.05■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 SCN7AQ01118 1682 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 RGL2O15211 777 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 C1QTNF8P60827 252 aa25.03■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 FKBP8Q14318 412 aa25.03■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 NGEFQ8N5V2 710 aa25.03■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.02■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 NBPF26B4DH59 902 aa25.02■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 CCER2I3L3R5 266 aa25.02■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 HOXB7P09629 217 aa25.02■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 NBPF15Q8N660 670 aa25.02■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.02■■□□□ 1.6
C9orf129-201ENST00000375419 TM4SF1P30408 202 aa25.01■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 GNAI1P63096 354 aa25.01■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.01■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 PARP3Q9Y6F1 533 aa25■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 CAMTA2O94983 1202 aa24.99■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 IL16Q14005 1332 aa24.99■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 WWC1Q8IX03 1113 aa24.99■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 BCORQ6W2J9 1755 aa24.98■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 DDR1Q08345 913 aa24.98■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 MBIPQ9NS73 344 aa24.98■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.97■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.97■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 NFIXQ14938 502 aa24.96■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.96■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.96■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
C9orf129-201ENST00000375419 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 TGFB2P61812 414 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 PDIA6Q15084 440 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 WDR63Q8IWG1 891 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 KRT24Q2M2I5 525 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.9■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.9■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.89■■□□□ 1.58
C9orf129-201ENST00000375419 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms