RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
CRIP1-201ENST00000330233 USP16Q9Y5T5 823 aa34.81■■■■□ 3.16
CRIP1-201ENST00000330233 RPS6KA4O75676 772 aa34.8■■■■□ 3.16
CRIP1-201ENST00000330233 SSFA2P28290 1259 aa34.79■■■■□ 3.16
CRIP1-201ENST00000330233 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
CRIP1-201ENST00000330233 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa34.77■■■■□ 3.16
CRIP1-201ENST00000330233 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa34.76■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF521Q96K83 1311 aa34.75■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 ADRA2BP18089 450 aa34.75■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 TRAPPC3LQ5T215 181 aa34.75■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 LAMB4A4D0S4 1761 aa34.73■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 PHF14O94880 888 aa34.72■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 SLC16A10Q8TF71 515 aa34.72■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 MSH5O43196 834 aa34.71■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 A1BGP04217 495 aa34.71■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 HOXB7P09629 217 aa34.71■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa34.71■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 CASZ1Q86V15 1759 aa34.71■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 CANXP27824 592 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA2Q08379 1002 aa34.7■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 AMIGO3Q86WK7 504 aa34.7■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 MYH16Q9H6N6 1097 aa34.7■■■■□ 3.15
CRIP1-201ENST00000330233 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 DUSP27Q5VZP5 1158 aa34.67■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 RFC4P35249 363 aa34.66■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP34.66■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 KRT24Q2M2I5 525 aa34.66■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 SMIM5Q71RC9 77 aa34.66■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 CHMP4AQ9BY43 222 aa34.66■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 EIF5P55010 431 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 A0A087WZG4 1122 aa34.64■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 ERBB4Q15303 1308 aa34.64■■■■□ 3.14
CRIP1-201ENST00000330233 MTFR1LQ9H019 292 aa34.63■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.63■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 E9PSI1 815 aa34.62■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 C8orf58Q8NAV2 365 aa34.62■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 COL15A1P39059 1388 aa34.6■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF26B4DH59 902 aa34.59■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB7AO95365 584 aa34.59■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF15Q8N660 670 aa34.59■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 SPON1Q9HCB6 807 aa34.59■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 ZPR1O75312 459 aa34.58■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 SLFN5Q08AF3 891 aa34.58■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa34.58■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 C4AP0C0L4 1744 aa34.58■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.13
CRIP1-201ENST00000330233 NARFQ9UHQ1 456 aa34.56■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 TSPYL6Q8N831 410 aa34.55■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 NECTIN2Q92692 538 aa34.55■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 MYL6BP14649 208 aa34.54■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 PDIA6Q15084 440 aa34.54■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 NLGN1Q8N2Q7 840 aa34.54■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.53■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.53■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 ARXQ96QS3 562 aa34.53■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 COL24A1Q17RW2 1714 aa34.52■■■■□ 3.12
CRIP1-201ENST00000330233 GYS1P13807 737 aa34.51■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa34.51■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 CACNA1FO60840 1977 aa34.5■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 USPL1Q5W0Q7 1092 aa34.5■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 POLD1P28340 1107 aa34.49■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 CHPF2Q9P2E5 772 aa34.49■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 ZBED9Q6R2W3 1325 aa34.48■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 VAMP4O75379 141 aa34.48■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 HYPKQ9NX55 129 aa34.48■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 MSL1Q68DK7 614 aa34.47■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 PROSER3Q2NL68 480 aa34.46■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 PTGER2P43116 358 aa34.45■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 LRP10Q7Z4F1 713 aa34.45■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 SGIP1Q9BQI5 828 aa34.45■■■■□ 3.11
CRIP1-201ENST00000330233 RGL2O15211 777 aa34.44■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 CAMTA2O94983 1202 aa34.44■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 ANXA1P04083 346 aa34.44■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 STK31Q9BXU1 1019 aa34.44■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 LRP5O75197 1615 aa34.44■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC4GQ6UXB4 293 aa34.43■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 KIF6Q6ZMV9 814 aa34.43■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 FKBP8Q14318 412 aa34.42■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 ERVV-1B6SEH8 477 aa34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms