RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa29.26■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC3LQ5T215 181 aa29.25■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.24■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.24■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.24■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 CHL1O00533 1208 aa29.23■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 STARD3NLO95772 234 aa29.23■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 ADRA2BP18089 450 aa29.23■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.22■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 CCER2I3L3R5 266 aa29.2■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 A1BGP04217 495 aa29.2■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 C4AP0C0L4 1744 aa29.2■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 ZNF853P0CG23 659 aa29.2■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 MSL1Q68DK7 614 aa29.2■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 EIF5P55010 431 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 CCDC27Q2M243 656 aa29.19■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 MIER1Q8N108 512 aa29.17■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 CFAP44Q96MT7 982 aa29.17■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 GYS1P13807 737 aa29.16■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 RFC4P35249 363 aa29.16■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 WWC1Q8IX03 1113 aa29.16■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SYF2-201ENST00000236273 NBPF26B4DH59 902 aa29.14■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 NBPF15Q8N660 670 aa29.14■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 ARXQ96QS3 562 aa29.14■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 COL15A1P39059 1388 aa29.13■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 KRT24Q2M2I5 525 aa29.12■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 MBIPQ9NS73 344 aa29.12■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 IFT57Q9NWB7 429 aa29.12■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 LAMB4A4D0S4 1761 aa29.11■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 POLD1P28340 1107 aa29.11■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.1■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 NARFQ9UHQ1 456 aa29.1■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 FKBP8Q14318 412 aa29.08■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.08■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 NLGN1Q8N2Q7 840 aa29.08■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SYF2-201ENST00000236273 GNAI1P63096 354 aa29.07■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.05■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WZG4 1122 aa29.04■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 ZPR1O75312 459 aa29.04■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 MMP10P09238 476 aa29.04■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 SYT17Q9BSW7 474 aa29.04■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 TM4SF1P30408 202 aa29.03■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 PDIA6Q15084 440 aa29.03■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 IL16Q14005 1332 aa29.03■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.02■■■□□ 2.24
SYF2-201ENST00000236273 CAMTA2O94983 1202 aa29.01■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 WDR63Q8IWG1 891 aa29.01■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 NGEFQ8N5V2 710 aa29■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 ZNF521Q96K83 1311 aa29■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 DDR1Q08345 913 aa28.99■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.99■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 HOXB7P09629 217 aa28.98■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.98■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 ERBB4Q15303 1308 aa28.98■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 NFIXQ14938 502 aa28.97■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 PROSER3Q2NL68 480 aa28.97■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 SCN7AQ01118 1682 aa28.97■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 NECTIN2Q92692 538 aa28.96■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 MYL6BP14649 208 aa28.95■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 BCORQ6W2J9 1755 aa28.95■■■□□ 2.23
SYF2-201ENST00000236273 ANXA1P04083 346 aa28.94■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.94■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 TSPYL6Q8N831 410 aa28.94■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.94■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.94■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.94■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.93■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 KLHL34Q8N239 644 aa28.92■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.91■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 HLFQ16534 295 aa28.91■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.91■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.9■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.9■■■□□ 2.22
SYF2-201ENST00000236273 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms