RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ift57Q8BXG3 429 aa17.81■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Serpina10Q8R121 448 aa17.81■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tmem87bQ8BKU8 555 aa17.81■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fez1Q8K0X8 392 aa17.81■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Txndc16Q7TN22 820 aa17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Amotl2Q8K371 772 aa17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cul5Q9D5V5 780 aa17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Larp6Q8BN59 492 aa17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Traf3ip1Q149C2 625 aa17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cep120Q7TSG1 988 aa17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stxbp4Q9WV89 557 aa17.8■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pde4dQ01063 747 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Egfem1Q8C088 590 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dph6Q9CQ28 267 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cdan1Q8CC12 1239 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rad23bP54728 416 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wwc1Q5SXA9 1104 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tsg101Q61187 391 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ParvgQ9ERD8 331 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp7aQ64430 1491 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trim11Q99PQ2 467 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fancd2Q80V62 1450 aa17.79■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bin1O08539 588 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tmc2Q8R4P4 888 aa17.78■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa17.78■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Naip7Q9JIB3 1402 aa17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Naip6Q9JIB6 1403 aa17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 PrkcshO08795 521 aa17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm7347D3YYI9 267 aa17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Speer4aF8VPX6 267 aa17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnf216P58283 853 aa17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc66Q6NS45 935 aa17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gpatch8A2A6A1 1505 aa17.77■□□□□ 0.44
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ankrd13dQ6PD24 605 aa17.77■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Camsap2Q8C1B1 1461 aa17.77■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ces1aE9PYP1 563 aa17.77■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 EvcP57680 1005 aa17.77■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnf41Q8BH75 317 aa17.77■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 WizO88286 1684 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ncoa1P70365 1447 aa17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Limch1Q3UH68 1057 aa17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tacc1Q6Y685 774 aa17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Terf1P70371 421 aa17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fbf1A2A870 1173 aa17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ankle2Q6P1H6 964 aa17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 BC005561E9Q5E2 1589 aa17.76■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stx8O88983 236 aa17.75■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Triml1Q8BVP1 470 aa17.75■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa17.75■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa17.75■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Speer4dL7N216 212 aa17.75■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kdm5bQ80Y84 1544 aa17.75■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dydc1Q9D9T0 175 aa17.74■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Brms1Q99N20 246 aa17.74■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa17.74■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ncoa3O09000 1398 aa17.74■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnf34Q99KR6 376 aa17.74■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hoxa7P02830 229 aa17.74■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 St5Q924W7 1134 aa17.74■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Metap2O08663 478 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Frat2Q8K025 231 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tut1Q8R3F9 869 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nphp3Q7TNH6 1325 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kifc2O08672 792 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Homer1Q9Z2Y3 366 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Izumo3A6PWV3 263 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ankrd44B2RXR6 993 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam83gQ5SWY7 812 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp2b1G5E829 1220 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tom1O88746 492 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Jade2Q6ZQF7 829 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olr1Q9EQ09 363 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa17.73■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zscan29E9Q5B4 869 aa17.72■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Echdc1Q9D9V3 322 aa17.72■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Plekho1Q9JIY0 408 aa17.72■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prex2Q3LAC4 1598 aa17.72■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ift74Q8BKE9 600 aa17.72■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Def6Q8C2K1 630 aa17.72■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Jakmip2D3YXK0 820 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rasa1E9PYG6 1038 aa17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.5 ms