RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mmp8O70138 465 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CanxP35564 591 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atg4aQ8C9S8 396 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 ChgaP26339 463 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mum1Q6DID5 682 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ddx60E9PZQ1 1711 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kat6bQ8BRB7 1872 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nkx1-2P42580 305 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tceal9Q9DD24 104 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ier5O89113 308 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Crb1Q8VHS2 1405 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ginm1Q91WR6 327 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Erbb4Q61527 1308 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Shank2Q80Z38 1476 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Map3k13Q1HKZ5 959 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dnai1Q8C0M8 701 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mcmdc2E9Q956 681 aa23.38■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sik1Q60670 779 aa23.38■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ankle2Q6P1H6 964 aa23.38■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 ApobrQ8VBT6 942 aa23.38■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hoxa7P02830 229 aa23.37■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Igfbp6P47880 238 aa23.37■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Shank3Q4ACU6 1730 aa23.37■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mst1rQ62190 1378 aa23.37■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc39a6Q8C145 765 aa23.37■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hspa1lP16627 641 aa23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tlr7P58681 1050 aa23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cers3Q1A3B0 383 aa23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppm1mQ8BU27 406 aa23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trim52Q8CDV4 233 aa23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttll7A4Q9F0 912 aa23.35■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Grm8P47743 908 aa23.35■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nek4Q9Z1J2 792 aa23.35■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa23.34■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa23.34■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rabep1O35551 862 aa23.33■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CenppQ9CZ92 286 aa23.33■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Exoc5Q3TPX4 708 aa23.33■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa23.33■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa23.33■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lrp6O88572 1613 aa23.32■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pm20d1Q8C165 503 aa23.32■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ddx58Q6Q899 926 aa23.31■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mylk2Q8VCR8 613 aa23.31■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ggt6Q6PDE7 497 aa23.3■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa23.3■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ankrd23Q812A3 306 aa23.3■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MypnQ5DTJ9 1315 aa23.29■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fer1l6E0CZ42 1862 aa23.29■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nav1Q8CH77 1875 aa23.29■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zkscan2G3X952 960 aa23.29■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc129Q14B48 1034 aa23.29■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tgfb1i1Q62219 461 aa23.28■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa23.28■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cap2Q9CYT6 476 aa23.28■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bcar3Q9QZK2 820 aa23.28■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mast2Q60592 1734 aa23.28■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cct4P80315 539 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 VgfQ0VGU4 617 aa23.28■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa23.28■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nwd2Q6P5U7 1742 aa23.27■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm12185Q5NCB2 835 aa23.27■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hspa2P17156 633 aa23.26■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa23.26■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Syde2E9PUP1 1314 aa23.26■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Col4a1P02463 1669 aa23.25■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Vps33bP59016 617 aa23.25■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fkbp5Q64378 456 aa23.25■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sptbn5F6UCX4 1208 aa23.25■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ripor2Q80U16 1078 aa23.24■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Psrc1Q9D0P7 329 aa23.24■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cacna1sQ02789 1880 aa23.23■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hmox1P14901 289 aa23.22■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Jmjd4Q8BFT6 427 aa23.22■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Soga3Q6NZL0 945 aa23.22■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nlrp9bQ66X22 1003 aa23.21■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Abcc4E9Q236 1325 aa23.21■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pde4dQ01063 747 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dcaf5Q80T85 946 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppp6r3Q922D4 844 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Q9D2X8 372 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 InsrrQ9WTL4 1300 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ank1Q02357 1862 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NmiO35309 314 aa23.19■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.1 ms