RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hoxc5P32043 222 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 HccsP53702 272 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tm9sf2P58021 662 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Siah1aP61092 282 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc30a3P97441 388 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PrkczQ02956 592 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Siah1bQ06985 282 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AmbpQ07456 349 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ano7Q14AT5 859 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm906Q3V0M1 1017 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PigaQ64323 485 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tdpoz3Q717B4 365 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc6a5Q761V0 799 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf12Q7TSI0 686 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 LipmQ8K2A6 422 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dok4Q99KE3 325 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Metap1dQ9CPW9 335 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bud23Q9CY21 281 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vamp5Q9Z2P8 102 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Myo5bP21271 1818 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AccsA2AIG8 502 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adam34A2RSG8 714 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 A430033K04RikE9Q8G5 680 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AlpiF8VPQ6 554 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CrymO54983 313 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Btnl2O70355 454 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Soat2O88908 525 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 UoxP25688 303 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam178bQ24JP3 464 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Klhl21Q3U410 597 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Qrich1Q3UA37 777 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vezf1Q5SXC4 518 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Alkbh2Q6P6J4 239 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DraxinQ6PAL1 343 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ssxb3Q6XAS4 170 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccdc126Q8BIS8 140 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ptgr2Q8VDQ1 351 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccdc115Q8VE99 180 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tram1Q91V04 374 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TpbpbQ9CQC0 121 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rgs19Q9CX84 216 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Anks3Q9CZK6 655 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cntnap4Q99P47 1310 aa9□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ank1Q02357 1862 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm11127A7VMS2 374 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prl8a2O54832 240 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gabarapl2P60521 117 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pyroxd2Q3U4I7 581 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Klrg2Q3UM83 387 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Samhd1Q60710 627 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Map3k3Q61084 626 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Map4k2Q61161 821 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp429Q7M6Y0 485 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PrcpQ7TMR0 491 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rnf139Q7TMV1 668 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Spata21Q8BHW6 681 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Itpk1Q8BYN3 419 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf276Q8CE64 614 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nxnl1Q8VC33 217 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Naa40Q8VE10 237 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrch4Q921G6 680 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tktl1Q99MX0 595 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acss2Q9QXG4 701 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cav2Q9WVC3 162 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Auts2A0A087WPF7 1261 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm14147A2AQX6 640 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm21319F6YNI8 144 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 OpcmlG5E8G3 345 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ifnar2O35664 513 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pou3f3P31361 497 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cdh4P39038 913 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hmx2P43687 273 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Atoh1P48985 351 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Limk1P53668 647 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RykQ01887 594 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 XylbQ3TNA1 551 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AlcamQ61490 583 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rap2aQ80ZJ1 183 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pxylp1Q8BHA9 480 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Phf11aQ8BVM9 293 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 1700020N01RikQ8CF20 87 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 FgbQ8K0E8 481 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr77Q8VEY9 312 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RragcQ99K70 398 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Emc2Q9CRD2 297 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mrpl21Q9D1N9 209 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RtcAQ9D7H3 366 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Msl3Q9WVG9 525 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nup188Q6ZQH8 1759 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mup19A9C497 187 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mup8E9PVW0 235 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mup7E9QA79 235 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp994J3QM38 661 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.1 ms