Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG4

Acss2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss2Q9QXG4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Acss2Q9QXG4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Acss2Q9QXG4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Acss2Q9QXG4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Acss2Q9QXG4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Acss2Q9QXG4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Acss2Q9QXG4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Acss2Q9QXG4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Acss2Q9QXG4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Acss2Q9QXG4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Acss2Q9QXG4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Acss2Q9QXG4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Acss2Q9QXG4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Acss2Q9QXG4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Acss2Q9QXG4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Acss2Q9QXG4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Acss2Q9QXG4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Acss2Q9QXG4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Acss2Q9QXG4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Acss2Q9QXG4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Acss2Q9QXG4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Acss2Q9QXG4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Acss2Q9QXG4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Acss2Q9QXG4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Acss2Q9QXG4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Acss2Q9QXG4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Acss2Q9QXG4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Acss2Q9QXG4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Acss2Q9QXG4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Acss2Q9QXG4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Acss2Q9QXG4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Acss2Q9QXG4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Acss2Q9QXG4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Acss2Q9QXG4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Acss2Q9QXG4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Acss2Q9QXG4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Acss2Q9QXG4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Acss2Q9QXG4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Acss2Q9QXG4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Acss2Q9QXG4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Acss2Q9QXG4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Acss2Q9QXG4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Acss2Q9QXG4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Acss2Q9QXG4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Acss2Q9QXG4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Acss2Q9QXG4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Acss2Q9QXG4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Acss2Q9QXG4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Acss2Q9QXG4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Acss2Q9QXG4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Acss2Q9QXG4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Acss2Q9QXG4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Acss2Q9QXG4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Acss2Q9QXG4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Acss2Q9QXG4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Acss2Q9QXG4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Acss2Q9QXG4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Acss2Q9QXG4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Acss2Q9QXG4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Acss2Q9QXG4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Acss2Q9QXG4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Acss2Q9QXG4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Acss2Q9QXG4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Acss2Q9QXG4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Acss2Q9QXG4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Acss2Q9QXG4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Acss2Q9QXG4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Acss2Q9QXG4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acss2Q9QXG4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Acss2Q9QXG4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Acss2Q9QXG4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acss2Q9QXG4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Acss2Q9QXG4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Acss2Q9QXG4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Acss2Q9QXG4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Acss2Q9QXG4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Acss2Q9QXG4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Acss2Q9QXG4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Acss2Q9QXG4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Acss2Q9QXG4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Acss2Q9QXG4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Acss2Q9QXG4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Acss2Q9QXG4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Acss2Q9QXG4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Acss2Q9QXG4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Acss2Q9QXG4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Acss2Q9QXG4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Acss2Q9QXG4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Acss2Q9QXG4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Acss2Q9QXG4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Acss2Q9QXG4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Acss2Q9QXG4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Acss2Q9QXG4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Acss2Q9QXG4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Acss2Q9QXG4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Acss2Q9QXG4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Acss2Q9QXG4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Acss2Q9QXG4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Acss2Q9QXG4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Acss2Q9QXG4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms