Protein–RNA interactions for Protein: O54983

Crym, Ketimine reductase mu-crystallin, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrymO54983 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CrymO54983 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CrymO54983 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CrymO54983 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CrymO54983 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CrymO54983 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CrymO54983 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CrymO54983 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CrymO54983 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CrymO54983 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CrymO54983 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CrymO54983 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CrymO54983 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CrymO54983 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CrymO54983 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CrymO54983 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CrymO54983 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CrymO54983 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CrymO54983 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CrymO54983 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CrymO54983 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CrymO54983 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CrymO54983 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CrymO54983 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CrymO54983 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CrymO54983 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CrymO54983 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CrymO54983 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CrymO54983 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CrymO54983 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CrymO54983 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CrymO54983 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CrymO54983 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CrymO54983 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CrymO54983 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CrymO54983 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CrymO54983 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CrymO54983 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CrymO54983 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CrymO54983 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CrymO54983 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CrymO54983 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CrymO54983 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CrymO54983 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CrymO54983 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CrymO54983 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CrymO54983 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CrymO54983 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CrymO54983 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CrymO54983 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CrymO54983 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CrymO54983 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CrymO54983 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CrymO54983 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CrymO54983 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CrymO54983 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CrymO54983 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CrymO54983 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CrymO54983 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CrymO54983 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CrymO54983 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrymO54983 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CrymO54983 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CrymO54983 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CrymO54983 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CrymO54983 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CrymO54983 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CrymO54983 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CrymO54983 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CrymO54983 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CrymO54983 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CrymO54983 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CrymO54983 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CrymO54983 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CrymO54983 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CrymO54983 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CrymO54983 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CrymO54983 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CrymO54983 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CrymO54983 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CrymO54983 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CrymO54983 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CrymO54983 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CrymO54983 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CrymO54983 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CrymO54983 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CrymO54983 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CrymO54983 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CrymO54983 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CrymO54983 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CrymO54983 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CrymO54983 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrymO54983 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CrymO54983 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CrymO54983 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrymO54983 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CrymO54983 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CrymO54983 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CrymO54983 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CrymO54983 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms