Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
Msl3Q9WVG9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Msl3Q9WVG9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Msl3Q9WVG9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Msl3Q9WVG9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Msl3Q9WVG9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Msl3Q9WVG9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Msl3Q9WVG9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Msl3Q9WVG9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Msl3Q9WVG9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Msl3Q9WVG9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Msl3Q9WVG9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Msl3Q9WVG9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Msl3Q9WVG9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Msl3Q9WVG9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Msl3Q9WVG9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Msl3Q9WVG9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Msl3Q9WVG9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Msl3Q9WVG9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Msl3Q9WVG9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Msl3Q9WVG9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Msl3Q9WVG9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Msl3Q9WVG9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Msl3Q9WVG9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Msl3Q9WVG9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Msl3Q9WVG9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Msl3Q9WVG9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Msl3Q9WVG9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Msl3Q9WVG9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Msl3Q9WVG9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Msl3Q9WVG9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Msl3Q9WVG9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Msl3Q9WVG9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Msl3Q9WVG9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Msl3Q9WVG9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Msl3Q9WVG9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Msl3Q9WVG9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Msl3Q9WVG9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Msl3Q9WVG9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Msl3Q9WVG9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Msl3Q9WVG9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Msl3Q9WVG9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Msl3Q9WVG9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Msl3Q9WVG9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Msl3Q9WVG9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Msl3Q9WVG9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Msl3Q9WVG9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Msl3Q9WVG9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Msl3Q9WVG9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Msl3Q9WVG9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Msl3Q9WVG9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Msl3Q9WVG9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Msl3Q9WVG9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Msl3Q9WVG9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Msl3Q9WVG9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Msl3Q9WVG9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Msl3Q9WVG9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Msl3Q9WVG9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Msl3Q9WVG9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Msl3Q9WVG9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Msl3Q9WVG9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Msl3Q9WVG9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Msl3Q9WVG9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Msl3Q9WVG9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Msl3Q9WVG9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Msl3Q9WVG9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Msl3Q9WVG9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Msl3Q9WVG9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Msl3Q9WVG9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Msl3Q9WVG9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Msl3Q9WVG9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Msl3Q9WVG9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Msl3Q9WVG9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Msl3Q9WVG9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Msl3Q9WVG9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Msl3Q9WVG9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Msl3Q9WVG9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Msl3Q9WVG9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Msl3Q9WVG9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Msl3Q9WVG9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Msl3Q9WVG9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Msl3Q9WVG9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Msl3Q9WVG9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Msl3Q9WVG9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Msl3Q9WVG9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Msl3Q9WVG9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Msl3Q9WVG9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Msl3Q9WVG9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Msl3Q9WVG9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Msl3Q9WVG9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Msl3Q9WVG9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Msl3Q9WVG9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Msl3Q9WVG9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Msl3Q9WVG9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Msl3Q9WVG9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Msl3Q9WVG9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Msl3Q9WVG9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Msl3Q9WVG9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Msl3Q9WVG9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Msl3Q9WVG9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms