Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Cdh4P39038 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdh4P39038 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdh4P39038 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cdh4P39038 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Cdh4P39038 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cdh4P39038 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cdh4P39038 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cdh4P39038 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdh4P39038 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cdh4P39038 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdh4P39038 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdh4P39038 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdh4P39038 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdh4P39038 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Cdh4P39038 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdh4P39038 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdh4P39038 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdh4P39038 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdh4P39038 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdh4P39038 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdh4P39038 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdh4P39038 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdh4P39038 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdh4P39038 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdh4P39038 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdh4P39038 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdh4P39038 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdh4P39038 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdh4P39038 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdh4P39038 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdh4P39038 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdh4P39038 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdh4P39038 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdh4P39038 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdh4P39038 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdh4P39038 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdh4P39038 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdh4P39038 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdh4P39038 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdh4P39038 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdh4P39038 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdh4P39038 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdh4P39038 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdh4P39038 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdh4P39038 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdh4P39038 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdh4P39038 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdh4P39038 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdh4P39038 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdh4P39038 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh4P39038 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh4P39038 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh4P39038 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdh4P39038 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdh4P39038 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdh4P39038 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh4P39038 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdh4P39038 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh4P39038 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh4P39038 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdh4P39038 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdh4P39038 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdh4P39038 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdh4P39038 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdh4P39038 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh4P39038 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh4P39038 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdh4P39038 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdh4P39038 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh4P39038 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdh4P39038 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh4P39038 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdh4P39038 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdh4P39038 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdh4P39038 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdh4P39038 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdh4P39038 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdh4P39038 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdh4P39038 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdh4P39038 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdh4P39038 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdh4P39038 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdh4P39038 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdh4P39038 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh4P39038 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdh4P39038 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdh4P39038 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdh4P39038 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdh4P39038 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdh4P39038 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdh4P39038 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdh4P39038 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdh4P39038 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdh4P39038 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdh4P39038 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh4P39038 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdh4P39038 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdh4P39038 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdh4P39038 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms