RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Phf11cB4XVP9 339 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Opn1mwO35599 359 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 IkbkgO88522 412 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc1a5P51912 553 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Coq10bQ3THF9 240 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rfx4Q7TNK1 735 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmco6Q8BQX5 494 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rab28Q99KL7 221 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mtif3Q9CZD5 276 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plscr1Q9JJ00 328 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Irx5Q9JKQ4 484 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Unc13cQ8K0T7 2210 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tex13aA2AFS9 377 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn2r61L7N2B8 865 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 H2-Q7P14429 334 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 H2-Q9P14431 200 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 GhrhrP32082 423 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rps13P62301 151 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcnh6Q32ME0 950 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp4aQ64436 1033 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 C2cd4bQ80XU5 340 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q8C3W1 322 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa22.35■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Saxo1B1AXP3 476 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gabrg2P22723 474 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ephx2P34914 554 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sra1Q80VJ2 232 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Samd4bQ80XS6 687 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rbm11Q80YT9 238 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf410Q8BKX7 478 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cpne3Q8BT60 533 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 CntrobQ8CB62 887 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Foxe1Q8R2I0 371 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm16286Q9CQX6 220 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mcemp1Q9D8U6 183 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wdr53Q9DB94 358 aa22.34■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfp352A2AML7 551 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Serpina3jD3Z451 420 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Srp54bE9PXC0 504 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Htr5bP31387 370 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Id2P41136 134 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gal3st3P61315 431 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ebf1Q07802 591 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q3U7U4 132 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rnf43Q5NCP0 784 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zmiz1Q6P1E1 1072 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q6P1I3 445 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dennd5aQ6PAL8 1287 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 TbcelQ8C5W3 424 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr853Q8VGG6 305 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm1110F6Y113 635 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 PamP97467 979 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 B230104I21RikQ3USW4 141 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sec24dQ6NXL1 1032 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cypt4Q6P925 153 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cep68Q8C0D9 733 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gpr158Q8C419 1200 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 CcinQ8CDE2 588 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dusp15Q8R4V2 235 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mtfr1Q99MB2 328 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp5dQ9D3D9 168 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sppl2aQ9JJF9 523 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gsk3bQ9WV60 420 aa22.33■■□□□ 1.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfp964B2RR88 472 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Defa8P50706 81 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Grin2cQ01098 1239 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Msto1Q2YDW2 556 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Uap1l1Q3TW96 507 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q3USZ8 430 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fbxl19Q6PB97 674 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sgo2Q7TSY8 1164 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lair1Q8BG84 263 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mtrf1lQ8BJU9 373 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Clptm1Q8VBZ3 664 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 KptnQ8VCX6 430 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gid8Q9D7M1 228 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Yae1d1Q9DAY6 216 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmprss6Q9DBI0 811 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Itih4A6X935 942 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lipo4D3Z608 396 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm43302L7N1X8 611 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ctnnd2O35927 1247 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Akr1c6P70694 323 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gbp10Q000W5 611 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 HexdcQ3U4H6 486 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc23a3Q60850 611 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trpc1Q61056 793 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pex11gQ6P6M5 241 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa22.32■■□□□ 1.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim17Q7TPM3 477 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.6 ms