Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV60

Gsk3b, Glycogen synthase kinase-3 beta, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsk3bQ9WV60 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gsk3bQ9WV60 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Gsk3bQ9WV60 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gsk3bQ9WV60 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gsk3bQ9WV60 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Gsk3bQ9WV60 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gsk3bQ9WV60 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gsk3bQ9WV60 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gsk3bQ9WV60 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gsk3bQ9WV60 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gsk3bQ9WV60 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gsk3bQ9WV60 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gsk3bQ9WV60 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gsk3bQ9WV60 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gsk3bQ9WV60 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Gsk3bQ9WV60 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gsk3bQ9WV60 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gsk3bQ9WV60 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gsk3bQ9WV60 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gsk3bQ9WV60 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gsk3bQ9WV60 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gsk3bQ9WV60 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gsk3bQ9WV60 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gsk3bQ9WV60 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gsk3bQ9WV60 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gsk3bQ9WV60 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gsk3bQ9WV60 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gsk3bQ9WV60 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gsk3bQ9WV60 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gsk3bQ9WV60 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gsk3bQ9WV60 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gsk3bQ9WV60 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gsk3bQ9WV60 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gsk3bQ9WV60 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gsk3bQ9WV60 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gsk3bQ9WV60 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gsk3bQ9WV60 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Gsk3bQ9WV60 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gsk3bQ9WV60 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gsk3bQ9WV60 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gsk3bQ9WV60 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gsk3bQ9WV60 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gsk3bQ9WV60 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gsk3bQ9WV60 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gsk3bQ9WV60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gsk3bQ9WV60 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gsk3bQ9WV60 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gsk3bQ9WV60 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gsk3bQ9WV60 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gsk3bQ9WV60 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gsk3bQ9WV60 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gsk3bQ9WV60 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gsk3bQ9WV60 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gsk3bQ9WV60 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gsk3bQ9WV60 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gsk3bQ9WV60 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gsk3bQ9WV60 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gsk3bQ9WV60 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gsk3bQ9WV60 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gsk3bQ9WV60 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gsk3bQ9WV60 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Gsk3bQ9WV60 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gsk3bQ9WV60 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gsk3bQ9WV60 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gsk3bQ9WV60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gsk3bQ9WV60 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gsk3bQ9WV60 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gsk3bQ9WV60 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gsk3bQ9WV60 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gsk3bQ9WV60 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gsk3bQ9WV60 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gsk3bQ9WV60 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gsk3bQ9WV60 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gsk3bQ9WV60 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gsk3bQ9WV60 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gsk3bQ9WV60 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gsk3bQ9WV60 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gsk3bQ9WV60 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gsk3bQ9WV60 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gsk3bQ9WV60 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gsk3bQ9WV60 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gsk3bQ9WV60 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gsk3bQ9WV60 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gsk3bQ9WV60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gsk3bQ9WV60 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gsk3bQ9WV60 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gsk3bQ9WV60 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gsk3bQ9WV60 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gsk3bQ9WV60 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gsk3bQ9WV60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gsk3bQ9WV60 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gsk3bQ9WV60 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gsk3bQ9WV60 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gsk3bQ9WV60 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gsk3bQ9WV60 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gsk3bQ9WV60 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gsk3bQ9WV60 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gsk3bQ9WV60 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gsk3bQ9WV60 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gsk3bQ9WV60 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms