Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXL1

Sec24d, Sec24-related gene family, member D (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24dQ6NXL1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,73■■■■□ 3,47
Sec24dQ6NXL1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Sec24dQ6NXL1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Sec24dQ6NXL1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Sec24dQ6NXL1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,31■■■□□ 2,76
Sec24dQ6NXL1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Sec24dQ6NXL1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Sec24dQ6NXL1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Sec24dQ6NXL1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Sec24dQ6NXL1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Sec24dQ6NXL1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sec24dQ6NXL1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Sec24dQ6NXL1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
Sec24dQ6NXL1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Sec24dQ6NXL1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Sec24dQ6NXL1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Sec24dQ6NXL1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Sec24dQ6NXL1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Sec24dQ6NXL1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sec24dQ6NXL1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Sec24dQ6NXL1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sec24dQ6NXL1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Sec24dQ6NXL1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Sec24dQ6NXL1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Sec24dQ6NXL1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Sec24dQ6NXL1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Sec24dQ6NXL1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Sec24dQ6NXL1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Sec24dQ6NXL1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Sec24dQ6NXL1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Sec24dQ6NXL1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Sec24dQ6NXL1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Sec24dQ6NXL1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Sec24dQ6NXL1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Sec24dQ6NXL1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sec24dQ6NXL1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sec24dQ6NXL1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Sec24dQ6NXL1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Sec24dQ6NXL1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Sec24dQ6NXL1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sec24dQ6NXL1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Sec24dQ6NXL1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Sec24dQ6NXL1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Sec24dQ6NXL1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Sec24dQ6NXL1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Sec24dQ6NXL1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Sec24dQ6NXL1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Sec24dQ6NXL1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Sec24dQ6NXL1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Sec24dQ6NXL1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Sec24dQ6NXL1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Sec24dQ6NXL1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Sec24dQ6NXL1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Sec24dQ6NXL1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Sec24dQ6NXL1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Sec24dQ6NXL1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Sec24dQ6NXL1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Sec24dQ6NXL1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Sec24dQ6NXL1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Sec24dQ6NXL1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Sec24dQ6NXL1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Sec24dQ6NXL1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Sec24dQ6NXL1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Sec24dQ6NXL1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Sec24dQ6NXL1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Sec24dQ6NXL1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Sec24dQ6NXL1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Sec24dQ6NXL1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Sec24dQ6NXL1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Sec24dQ6NXL1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Sec24dQ6NXL1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Sec24dQ6NXL1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Sec24dQ6NXL1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Sec24dQ6NXL1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Sec24dQ6NXL1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Sec24dQ6NXL1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Sec24dQ6NXL1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Sec24dQ6NXL1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Sec24dQ6NXL1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Sec24dQ6NXL1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Sec24dQ6NXL1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Sec24dQ6NXL1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Sec24dQ6NXL1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Sec24dQ6NXL1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Sec24dQ6NXL1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Sec24dQ6NXL1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Sec24dQ6NXL1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Sec24dQ6NXL1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Sec24dQ6NXL1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Sec24dQ6NXL1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Sec24dQ6NXL1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Sec24dQ6NXL1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Sec24dQ6NXL1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Sec24dQ6NXL1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Sec24dQ6NXL1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Sec24dQ6NXL1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sec24dQ6NXL1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sec24dQ6NXL1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Sec24dQ6NXL1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Sec24dQ6NXL1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,9 ms