Protein–RNA interactions for Protein: B1AXP3

Saxo1, MCG1697, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saxo1B1AXP3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,96■■■■□ 3,67
Saxo1B1AXP3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Saxo1B1AXP3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Saxo1B1AXP3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,24■■■□□ 2,91
Saxo1B1AXP3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Saxo1B1AXP3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Saxo1B1AXP3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
Saxo1B1AXP3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Saxo1B1AXP3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Saxo1B1AXP3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Saxo1B1AXP3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Saxo1B1AXP3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Saxo1B1AXP3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,74■■■□□ 2,67
Saxo1B1AXP3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Saxo1B1AXP3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Saxo1B1AXP3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Saxo1B1AXP3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Saxo1B1AXP3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Saxo1B1AXP3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Saxo1B1AXP3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
Saxo1B1AXP3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Saxo1B1AXP3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Saxo1B1AXP3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Saxo1B1AXP3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Saxo1B1AXP3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Saxo1B1AXP3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Saxo1B1AXP3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Saxo1B1AXP3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Saxo1B1AXP3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,19■■■□□ 2,42
Saxo1B1AXP3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Saxo1B1AXP3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Saxo1B1AXP3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Saxo1B1AXP3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Saxo1B1AXP3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Saxo1B1AXP3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Saxo1B1AXP3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Saxo1B1AXP3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Saxo1B1AXP3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Saxo1B1AXP3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Saxo1B1AXP3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Saxo1B1AXP3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Saxo1B1AXP3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Saxo1B1AXP3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Saxo1B1AXP3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Saxo1B1AXP3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Saxo1B1AXP3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Saxo1B1AXP3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Saxo1B1AXP3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Saxo1B1AXP3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Saxo1B1AXP3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Saxo1B1AXP3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Saxo1B1AXP3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Saxo1B1AXP3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Saxo1B1AXP3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Saxo1B1AXP3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Saxo1B1AXP3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Saxo1B1AXP3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Saxo1B1AXP3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Saxo1B1AXP3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Saxo1B1AXP3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Saxo1B1AXP3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Saxo1B1AXP3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Saxo1B1AXP3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Saxo1B1AXP3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Saxo1B1AXP3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Saxo1B1AXP3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Saxo1B1AXP3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Saxo1B1AXP3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Saxo1B1AXP3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Saxo1B1AXP3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Saxo1B1AXP3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Saxo1B1AXP3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Saxo1B1AXP3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Saxo1B1AXP3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Saxo1B1AXP3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Saxo1B1AXP3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Saxo1B1AXP3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Saxo1B1AXP3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Saxo1B1AXP3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Saxo1B1AXP3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Saxo1B1AXP3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Saxo1B1AXP3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Saxo1B1AXP3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Saxo1B1AXP3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Saxo1B1AXP3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Saxo1B1AXP3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Saxo1B1AXP3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Saxo1B1AXP3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Saxo1B1AXP3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,95■■■□□ 2,07
Saxo1B1AXP3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Saxo1B1AXP3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Saxo1B1AXP3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Saxo1B1AXP3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Saxo1B1AXP3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Saxo1B1AXP3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Saxo1B1AXP3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Saxo1B1AXP3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Saxo1B1AXP3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Saxo1B1AXP3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Saxo1B1AXP3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms