Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Ctnnd2O35927 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ctnnd2O35927 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ctnnd2O35927 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ctnnd2O35927 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ctnnd2O35927 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ctnnd2O35927 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ctnnd2O35927 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ctnnd2O35927 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Ctnnd2O35927 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ctnnd2O35927 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Ctnnd2O35927 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ctnnd2O35927 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ctnnd2O35927 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ctnnd2O35927 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ctnnd2O35927 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ctnnd2O35927 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ctnnd2O35927 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ctnnd2O35927 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ctnnd2O35927 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ctnnd2O35927 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ctnnd2O35927 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ctnnd2O35927 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ctnnd2O35927 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ctnnd2O35927 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ctnnd2O35927 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctnnd2O35927 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ctnnd2O35927 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ctnnd2O35927 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ctnnd2O35927 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ctnnd2O35927 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ctnnd2O35927 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ctnnd2O35927 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ctnnd2O35927 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctnnd2O35927 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ctnnd2O35927 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ctnnd2O35927 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ctnnd2O35927 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ctnnd2O35927 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ctnnd2O35927 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ctnnd2O35927 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctnnd2O35927 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ctnnd2O35927 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctnnd2O35927 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ctnnd2O35927 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ctnnd2O35927 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ctnnd2O35927 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ctnnd2O35927 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ctnnd2O35927 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ctnnd2O35927 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctnnd2O35927 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctnnd2O35927 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ctnnd2O35927 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctnnd2O35927 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ctnnd2O35927 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ctnnd2O35927 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ctnnd2O35927 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ctnnd2O35927 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ctnnd2O35927 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ctnnd2O35927 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ctnnd2O35927 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ctnnd2O35927 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ctnnd2O35927 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ctnnd2O35927 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ctnnd2O35927 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ctnnd2O35927 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctnnd2O35927 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctnnd2O35927 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ctnnd2O35927 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctnnd2O35927 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ctnnd2O35927 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctnnd2O35927 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctnnd2O35927 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctnnd2O35927 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctnnd2O35927 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctnnd2O35927 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctnnd2O35927 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctnnd2O35927 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctnnd2O35927 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctnnd2O35927 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctnnd2O35927 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctnnd2O35927 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctnnd2O35927 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctnnd2O35927 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctnnd2O35927 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnnd2O35927 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctnnd2O35927 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctnnd2O35927 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctnnd2O35927 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctnnd2O35927 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctnnd2O35927 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctnnd2O35927 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctnnd2O35927 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctnnd2O35927 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ctnnd2O35927 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctnnd2O35927 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctnnd2O35927 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctnnd2O35927 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnnd2O35927 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnnd2O35927 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms