Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CntrobQ8CB62 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CntrobQ8CB62 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CntrobQ8CB62 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CntrobQ8CB62 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CntrobQ8CB62 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CntrobQ8CB62 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CntrobQ8CB62 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CntrobQ8CB62 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CntrobQ8CB62 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CntrobQ8CB62 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CntrobQ8CB62 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CntrobQ8CB62 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CntrobQ8CB62 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CntrobQ8CB62 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CntrobQ8CB62 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CntrobQ8CB62 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CntrobQ8CB62 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CntrobQ8CB62 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CntrobQ8CB62 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CntrobQ8CB62 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CntrobQ8CB62 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CntrobQ8CB62 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CntrobQ8CB62 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CntrobQ8CB62 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CntrobQ8CB62 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CntrobQ8CB62 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CntrobQ8CB62 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CntrobQ8CB62 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CntrobQ8CB62 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CntrobQ8CB62 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CntrobQ8CB62 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CntrobQ8CB62 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CntrobQ8CB62 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CntrobQ8CB62 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CntrobQ8CB62 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CntrobQ8CB62 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CntrobQ8CB62 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CntrobQ8CB62 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CntrobQ8CB62 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CntrobQ8CB62 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CntrobQ8CB62 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CntrobQ8CB62 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CntrobQ8CB62 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CntrobQ8CB62 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CntrobQ8CB62 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CntrobQ8CB62 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CntrobQ8CB62 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CntrobQ8CB62 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CntrobQ8CB62 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CntrobQ8CB62 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CntrobQ8CB62 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CntrobQ8CB62 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CntrobQ8CB62 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CntrobQ8CB62 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CntrobQ8CB62 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CntrobQ8CB62 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CntrobQ8CB62 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CntrobQ8CB62 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CntrobQ8CB62 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CntrobQ8CB62 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CntrobQ8CB62 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CntrobQ8CB62 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CntrobQ8CB62 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CntrobQ8CB62 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CntrobQ8CB62 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CntrobQ8CB62 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CntrobQ8CB62 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CntrobQ8CB62 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CntrobQ8CB62 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CntrobQ8CB62 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CntrobQ8CB62 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CntrobQ8CB62 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CntrobQ8CB62 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CntrobQ8CB62 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CntrobQ8CB62 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CntrobQ8CB62 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CntrobQ8CB62 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CntrobQ8CB62 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CntrobQ8CB62 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CntrobQ8CB62 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CntrobQ8CB62 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CntrobQ8CB62 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CntrobQ8CB62 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CntrobQ8CB62 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CntrobQ8CB62 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CntrobQ8CB62 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CntrobQ8CB62 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CntrobQ8CB62 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CntrobQ8CB62 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CntrobQ8CB62 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CntrobQ8CB62 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CntrobQ8CB62 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CntrobQ8CB62 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CntrobQ8CB62 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CntrobQ8CB62 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CntrobQ8CB62 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CntrobQ8CB62 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CntrobQ8CB62 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CntrobQ8CB62 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms