Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,35■■■■□ 3,25
Gm16286Q9CQX6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Gm16286Q9CQX6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Gm16286Q9CQX6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Gm16286Q9CQX6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Gm16286Q9CQX6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,89■■■□□ 2,69
Gm16286Q9CQX6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Gm16286Q9CQX6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Gm16286Q9CQX6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Gm16286Q9CQX6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
Gm16286Q9CQX6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Gm16286Q9CQX6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Gm16286Q9CQX6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Gm16286Q9CQX6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Gm16286Q9CQX6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Gm16286Q9CQX6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Gm16286Q9CQX6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Gm16286Q9CQX6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Gm16286Q9CQX6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Gm16286Q9CQX6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Gm16286Q9CQX6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Gm16286Q9CQX6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Gm16286Q9CQX6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Gm16286Q9CQX6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Gm16286Q9CQX6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gm16286Q9CQX6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gm16286Q9CQX6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Gm16286Q9CQX6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gm16286Q9CQX6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Gm16286Q9CQX6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gm16286Q9CQX6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Gm16286Q9CQX6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gm16286Q9CQX6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Gm16286Q9CQX6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Gm16286Q9CQX6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Gm16286Q9CQX6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Gm16286Q9CQX6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Gm16286Q9CQX6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Gm16286Q9CQX6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Gm16286Q9CQX6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Gm16286Q9CQX6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gm16286Q9CQX6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Gm16286Q9CQX6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Gm16286Q9CQX6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Gm16286Q9CQX6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Gm16286Q9CQX6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gm16286Q9CQX6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gm16286Q9CQX6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Gm16286Q9CQX6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gm16286Q9CQX6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gm16286Q9CQX6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gm16286Q9CQX6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Gm16286Q9CQX6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Gm16286Q9CQX6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Gm16286Q9CQX6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Gm16286Q9CQX6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Gm16286Q9CQX6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Gm16286Q9CQX6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gm16286Q9CQX6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,73■■■□□ 2,03
Gm16286Q9CQX6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Gm16286Q9CQX6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Gm16286Q9CQX6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Gm16286Q9CQX6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Gm16286Q9CQX6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Gm16286Q9CQX6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Gm16286Q9CQX6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Gm16286Q9CQX6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Gm16286Q9CQX6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Gm16286Q9CQX6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Gm16286Q9CQX6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Gm16286Q9CQX6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Gm16286Q9CQX6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Gm16286Q9CQX6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Gm16286Q9CQX6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Gm16286Q9CQX6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Gm16286Q9CQX6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Gm16286Q9CQX6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Gm16286Q9CQX6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Gm16286Q9CQX6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gm16286Q9CQX6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gm16286Q9CQX6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Gm16286Q9CQX6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Gm16286Q9CQX6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Gm16286Q9CQX6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Gm16286Q9CQX6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gm16286Q9CQX6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Gm16286Q9CQX6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Gm16286Q9CQX6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Gm16286Q9CQX6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Gm16286Q9CQX6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Gm16286Q9CQX6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Gm16286Q9CQX6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Gm16286Q9CQX6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Gm16286Q9CQX6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Gm16286Q9CQX6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Gm16286Q9CQX6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Gm16286Q9CQX6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Gm16286Q9CQX6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Gm16286Q9CQX6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Gm16286Q9CQX6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,3 ms