Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Defa8P50706 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,16■■■□□ 2,74
Defa8P50706 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Defa8P50706 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Defa8P50706 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Defa8P50706 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Defa8P50706 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Defa8P50706 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Defa8P50706 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Defa8P50706 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Defa8P50706 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Defa8P50706 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Defa8P50706 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Defa8P50706 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Defa8P50706 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Defa8P50706 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Defa8P50706 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Defa8P50706 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Defa8P50706 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Defa8P50706 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Defa8P50706 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Defa8P50706 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Defa8P50706 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Defa8P50706 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Defa8P50706 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Defa8P50706 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Defa8P50706 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Defa8P50706 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Defa8P50706 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Defa8P50706 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Defa8P50706 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Defa8P50706 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Defa8P50706 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Defa8P50706 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Defa8P50706 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Defa8P50706 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Defa8P50706 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Defa8P50706 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Defa8P50706 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Defa8P50706 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Defa8P50706 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Defa8P50706 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Defa8P50706 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Defa8P50706 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Defa8P50706 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Defa8P50706 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Defa8P50706 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Defa8P50706 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Defa8P50706 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Defa8P50706 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Defa8P50706 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Defa8P50706 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Defa8P50706 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Defa8P50706 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Defa8P50706 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Defa8P50706 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Defa8P50706 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Defa8P50706 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Defa8P50706 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Defa8P50706 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Defa8P50706 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Defa8P50706 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Defa8P50706 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Defa8P50706 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Defa8P50706 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Defa8P50706 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Defa8P50706 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Defa8P50706 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Defa8P50706 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Defa8P50706 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Defa8P50706 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Defa8P50706 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Defa8P50706 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Defa8P50706 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Defa8P50706 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Defa8P50706 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Defa8P50706 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Defa8P50706 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Defa8P50706 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Defa8P50706 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Defa8P50706 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Defa8P50706 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Defa8P50706 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Defa8P50706 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Defa8P50706 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Defa8P50706 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Defa8P50706 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Defa8P50706 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Defa8P50706 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Defa8P50706 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Defa8P50706 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Defa8P50706 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Defa8P50706 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Defa8P50706 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Defa8P50706 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Defa8P50706 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Defa8P50706 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Defa8P50706 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Defa8P50706 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Defa8P50706 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms