RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 FOXM1Q08050 763 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SLC20A2Q08357 652 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 BIRC3Q13489 604 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 BMPR2Q13873 1038 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TBCCQ15814 346 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ASIC2Q16515 512 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF699Q32M78 642 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 MTFR2Q6P444 385 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 VPS36Q86VN1 386 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 UNC93AQ86WB7 457 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 C12orf29Q8N999 325 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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PTPRK-211ENST00000429595 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ASB12Q8WXK4 309 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SH3GL2Q99962 352 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 GANQ9H2C0 597 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 DMAC2Q9NW81 257 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 GPR83Q9NYM4 423 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0U1RQJ8 604 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC53A6NM62 1247 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC188H7C350 402 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 GCNT3O95395 438 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 MT-CO1P00395 513 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 PDGFRAP16234 1089 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 PEX5P50542 639 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TBX4P57082 545 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 DNASE1L3Q13609 305 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ACAP2Q15057 778 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 KCNMB4Q86W47 210 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 IFT20Q8IY31 132 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TM9SF4Q92544 642 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 AZIN2Q96A70 460 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FOXC2Q99958 501 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 STRA6Q9BX79 667 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 DUSP16Q9BY84 665 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FAM107BQ9H098 131 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 C5AR2Q9P296 337 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 KLQ9UEF7 1012 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 IL36AQ9UHA7 158 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 PADI1Q9ULC6 663 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 RNF212BA8MTL3 300 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL41O60662 606 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TM7SF2O76062 418 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ZBED1O96006 694 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ALPPP05187 535 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 STSP08842 583 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 THRAP10827 490 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ADRB3P13945 408 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TKTL1P51854 596 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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