RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sohlh2Q9D489 467 aa20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr933Q9EQA0 308 aa20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acsl4Q9QUJ7 711 aa20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psma4Q9R1P0 261 aa20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CroccQ8CJ40 2009 aa20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm31371A0A1D5RM70 265 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1253A2AUA2 318 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AF366264G3X9P9 502 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pbx2O35984 430 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Btnl2O70355 454 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AldocP05063 363 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab8aP55258 207 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Syndig1lQ3USQ7 237 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim40Q3UWA4 246 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rassf5Q5EBH1 413 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taar7eQ5QD09 358 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Svs1Q6WIZ7 820 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sox11Q7M6Y2 395 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1251Q7TQZ3 318 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp57Q8C6P8 421 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr96Q8VFE3 313 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnajb9Q9QYI6 222 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Otud3B1AZ99 396 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7275E9Q1B3 247 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nkx1-1G3UXB3 402 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hoxb9P20615 250 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gja1P23242 382 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EsrrgP62509 458 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MybphP70402 483 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnj13P86046 360 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crisp1Q03401 244 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Inf2Q0GNC1 1273 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnh6Q32ME0 950 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr616Q3KPB0 317 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C1rbQ8CFG9 706 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BicralQ8CHH5 1074 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Micu1Q8VCX5 477 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DgkgQ91WG7 788 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdha8Q91Y12 946 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AdprmQ99KS6 340 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifi44lQ9BDB7 447 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prps2Q9CS42 318 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Det1Q9D0A0 550 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EbplQ9D0P0 206 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hs6st1Q9QYK5 411 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CpqQ9WVJ3 470 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm11758A2BEI6 360 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm11757A2BEI8 360 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17175E9Q528 179 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc31F6VYM1 502 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Obox5G3X9P6 291 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhox6O70238 227 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp1b2P14231 290 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 G6pdxQ00612 515 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plpp4Q0VBU9 271 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cmpk2Q3U5Q7 447 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 OmpQ64288 163 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt75Q8BGZ7 551 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trnt1Q8K1J6 434 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr801Q8VEU1 318 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr437Q8VEV1 310 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1263Q8VG63 306 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Recql5Q8VID5 982 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GlyatQ91XE0 296 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ClpsQ9CQC2 113 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl28Q9CR40 571 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PyurfQ9D1C3 112 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kat8Q9D1P2 458 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc22a17Q9D9E0 401 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ern1Q9EQY0 977 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtszQ9WUU7 306 aa20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf711A2ANX9 761 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp992B1ASD8 573 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm4775F7ANJ3 135 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hcn4O70507 1186 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Yap1P46938 488 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map3k7clP58500 142 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adra1bP97717 514 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam109bQ14B98 259 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il15raQ60819 263 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Runx3Q64131 409 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8BHR8 331 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxl3Q8C4V4 428 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp991Q8R1N3 573 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slco3a1Q8R3L5 710 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr352Q8VGJ9 315 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Yaf2Q99LW6 179 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddi1Q9DAF3 408 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nrp2O35375 931 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mkln1O89050 735 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2-Q8P14430 326 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BrafP28028 804 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ThrbP37242 461 aa20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2-Q6P79568 326 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.2 ms