Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
C1rbQ8CFG9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
C1rbQ8CFG9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
C1rbQ8CFG9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
C1rbQ8CFG9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C1rbQ8CFG9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
C1rbQ8CFG9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
C1rbQ8CFG9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
C1rbQ8CFG9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
C1rbQ8CFG9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
C1rbQ8CFG9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
C1rbQ8CFG9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
C1rbQ8CFG9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
C1rbQ8CFG9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
C1rbQ8CFG9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
C1rbQ8CFG9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
C1rbQ8CFG9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C1rbQ8CFG9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C1rbQ8CFG9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C1rbQ8CFG9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C1rbQ8CFG9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
C1rbQ8CFG9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
C1rbQ8CFG9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C1rbQ8CFG9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
C1rbQ8CFG9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
C1rbQ8CFG9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C1rbQ8CFG9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C1rbQ8CFG9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C1rbQ8CFG9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C1rbQ8CFG9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C1rbQ8CFG9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C1rbQ8CFG9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1rbQ8CFG9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1rbQ8CFG9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C1rbQ8CFG9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C1rbQ8CFG9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C1rbQ8CFG9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
C1rbQ8CFG9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C1rbQ8CFG9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C1rbQ8CFG9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C1rbQ8CFG9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C1rbQ8CFG9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C1rbQ8CFG9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C1rbQ8CFG9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1rbQ8CFG9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1rbQ8CFG9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
C1rbQ8CFG9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1rbQ8CFG9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1rbQ8CFG9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1rbQ8CFG9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1rbQ8CFG9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C1rbQ8CFG9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C1rbQ8CFG9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1rbQ8CFG9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1rbQ8CFG9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1rbQ8CFG9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C1rbQ8CFG9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C1rbQ8CFG9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C1rbQ8CFG9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C1rbQ8CFG9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1rbQ8CFG9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1rbQ8CFG9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C1rbQ8CFG9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C1rbQ8CFG9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C1rbQ8CFG9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1rbQ8CFG9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1rbQ8CFG9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1rbQ8CFG9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C1rbQ8CFG9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C1rbQ8CFG9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1rbQ8CFG9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1rbQ8CFG9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C1rbQ8CFG9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1rbQ8CFG9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1rbQ8CFG9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1rbQ8CFG9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1rbQ8CFG9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1rbQ8CFG9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1rbQ8CFG9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1rbQ8CFG9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1rbQ8CFG9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C1rbQ8CFG9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C1rbQ8CFG9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C1rbQ8CFG9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C1rbQ8CFG9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1rbQ8CFG9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C1rbQ8CFG9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1rbQ8CFG9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1rbQ8CFG9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1rbQ8CFG9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C1rbQ8CFG9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1rbQ8CFG9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1rbQ8CFG9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1rbQ8CFG9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C1rbQ8CFG9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1rbQ8CFG9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C1rbQ8CFG9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C1rbQ8CFG9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1rbQ8CFG9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1rbQ8CFG9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms