Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,77■■■■□ 3,16
BrafP28028 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
BrafP28028 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
BrafP28028 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
BrafP28028 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
BrafP28028 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
BrafP28028 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
BrafP28028 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,88■■■□□ 2,53
BrafP28028 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
BrafP28028 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
BrafP28028 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
BrafP28028 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
BrafP28028 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
BrafP28028 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
BrafP28028 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
BrafP28028 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
BrafP28028 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
BrafP28028 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
BrafP28028 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
BrafP28028 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
BrafP28028 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
BrafP28028 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
BrafP28028 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
BrafP28028 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
BrafP28028 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
BrafP28028 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
BrafP28028 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
BrafP28028 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
BrafP28028 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
BrafP28028 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
BrafP28028 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
BrafP28028 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
BrafP28028 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
BrafP28028 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
BrafP28028 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,52■■■□□ 2,16
BrafP28028 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,49■■■□□ 2,15
BrafP28028 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,43■■■□□ 2,14
BrafP28028 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
BrafP28028 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
BrafP28028 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
BrafP28028 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
BrafP28028 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
BrafP28028 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
BrafP28028 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
BrafP28028 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
BrafP28028 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
BrafP28028 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
BrafP28028 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
BrafP28028 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
BrafP28028 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
BrafP28028 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
BrafP28028 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
BrafP28028 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
BrafP28028 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
BrafP28028 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,6■■■□□ 2,01
BrafP28028 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
BrafP28028 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
BrafP28028 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
BrafP28028 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
BrafP28028 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
BrafP28028 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
BrafP28028 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
BrafP28028 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
BrafP28028 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
BrafP28028 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
BrafP28028 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
BrafP28028 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
BrafP28028 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
BrafP28028 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
BrafP28028 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
BrafP28028 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
BrafP28028 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
BrafP28028 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
BrafP28028 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
BrafP28028 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,12■■□□□ 1,93
BrafP28028 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
BrafP28028 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
BrafP28028 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
BrafP28028 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
BrafP28028 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,98■■□□□ 1,91
BrafP28028 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
BrafP28028 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
BrafP28028 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
BrafP28028 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
BrafP28028 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
BrafP28028 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
BrafP28028 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
BrafP28028 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,76■■□□□ 1,88
BrafP28028 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
BrafP28028 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
BrafP28028 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
BrafP28028 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
BrafP28028 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,59■■□□□ 1,85
BrafP28028 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
BrafP28028 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
BrafP28028 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
BrafP28028 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
BrafP28028 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
BrafP28028 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
BrafP28028 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms