Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Psma4Q9R1P0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Psma4Q9R1P0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Psma4Q9R1P0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Psma4Q9R1P0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Psma4Q9R1P0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Psma4Q9R1P0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Psma4Q9R1P0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Psma4Q9R1P0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Psma4Q9R1P0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Psma4Q9R1P0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Psma4Q9R1P0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psma4Q9R1P0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Psma4Q9R1P0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Psma4Q9R1P0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psma4Q9R1P0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Psma4Q9R1P0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psma4Q9R1P0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Psma4Q9R1P0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psma4Q9R1P0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psma4Q9R1P0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Psma4Q9R1P0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Psma4Q9R1P0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psma4Q9R1P0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psma4Q9R1P0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psma4Q9R1P0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psma4Q9R1P0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Psma4Q9R1P0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psma4Q9R1P0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Psma4Q9R1P0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psma4Q9R1P0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psma4Q9R1P0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psma4Q9R1P0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psma4Q9R1P0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psma4Q9R1P0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psma4Q9R1P0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psma4Q9R1P0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psma4Q9R1P0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psma4Q9R1P0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Psma4Q9R1P0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psma4Q9R1P0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psma4Q9R1P0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psma4Q9R1P0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Psma4Q9R1P0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psma4Q9R1P0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psma4Q9R1P0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psma4Q9R1P0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psma4Q9R1P0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psma4Q9R1P0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psma4Q9R1P0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Psma4Q9R1P0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psma4Q9R1P0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psma4Q9R1P0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Psma4Q9R1P0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psma4Q9R1P0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psma4Q9R1P0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psma4Q9R1P0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psma4Q9R1P0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psma4Q9R1P0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psma4Q9R1P0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psma4Q9R1P0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psma4Q9R1P0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psma4Q9R1P0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psma4Q9R1P0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Psma4Q9R1P0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psma4Q9R1P0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psma4Q9R1P0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psma4Q9R1P0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psma4Q9R1P0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Psma4Q9R1P0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Psma4Q9R1P0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Psma4Q9R1P0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Psma4Q9R1P0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Psma4Q9R1P0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psma4Q9R1P0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Psma4Q9R1P0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Psma4Q9R1P0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psma4Q9R1P0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psma4Q9R1P0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psma4Q9R1P0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psma4Q9R1P0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psma4Q9R1P0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psma4Q9R1P0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psma4Q9R1P0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psma4Q9R1P0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psma4Q9R1P0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psma4Q9R1P0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psma4Q9R1P0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psma4Q9R1P0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psma4Q9R1P0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psma4Q9R1P0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psma4Q9R1P0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Psma4Q9R1P0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psma4Q9R1P0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Psma4Q9R1P0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psma4Q9R1P0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psma4Q9R1P0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psma4Q9R1P0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psma4Q9R1P0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psma4Q9R1P0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms