Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,72■■■□□ 2,99
Psma4Q9R1P0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Psma4Q9R1P0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,4■■■□□ 2,62
Psma4Q9R1P0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Psma4Q9R1P0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Psma4Q9R1P0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Psma4Q9R1P0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Psma4Q9R1P0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Psma4Q9R1P0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Psma4Q9R1P0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Psma4Q9R1P0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Psma4Q9R1P0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Psma4Q9R1P0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Psma4Q9R1P0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Psma4Q9R1P0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Psma4Q9R1P0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Psma4Q9R1P0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Psma4Q9R1P0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Psma4Q9R1P0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Psma4Q9R1P0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Psma4Q9R1P0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Psma4Q9R1P0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Psma4Q9R1P0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Psma4Q9R1P0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Psma4Q9R1P0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Psma4Q9R1P0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Psma4Q9R1P0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Psma4Q9R1P0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Psma4Q9R1P0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Psma4Q9R1P0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Psma4Q9R1P0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Psma4Q9R1P0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Psma4Q9R1P0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Psma4Q9R1P0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Psma4Q9R1P0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Psma4Q9R1P0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Psma4Q9R1P0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Psma4Q9R1P0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Psma4Q9R1P0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Psma4Q9R1P0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Psma4Q9R1P0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Psma4Q9R1P0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Psma4Q9R1P0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Psma4Q9R1P0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Psma4Q9R1P0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Psma4Q9R1P0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Psma4Q9R1P0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Psma4Q9R1P0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Psma4Q9R1P0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Psma4Q9R1P0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Psma4Q9R1P0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Psma4Q9R1P0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Psma4Q9R1P0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Psma4Q9R1P0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Psma4Q9R1P0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Psma4Q9R1P0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Psma4Q9R1P0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Psma4Q9R1P0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Psma4Q9R1P0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Psma4Q9R1P0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Psma4Q9R1P0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Psma4Q9R1P0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Psma4Q9R1P0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Psma4Q9R1P0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Psma4Q9R1P0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Psma4Q9R1P0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Psma4Q9R1P0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Psma4Q9R1P0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Psma4Q9R1P0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Psma4Q9R1P0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Psma4Q9R1P0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Psma4Q9R1P0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Psma4Q9R1P0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Psma4Q9R1P0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Psma4Q9R1P0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Psma4Q9R1P0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Psma4Q9R1P0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Psma4Q9R1P0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Psma4Q9R1P0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Psma4Q9R1P0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Psma4Q9R1P0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Psma4Q9R1P0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Psma4Q9R1P0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Psma4Q9R1P0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Psma4Q9R1P0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Psma4Q9R1P0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Psma4Q9R1P0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Psma4Q9R1P0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Psma4Q9R1P0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Psma4Q9R1P0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Psma4Q9R1P0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Psma4Q9R1P0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Psma4Q9R1P0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Psma4Q9R1P0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Psma4Q9R1P0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Psma4Q9R1P0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Psma4Q9R1P0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Psma4Q9R1P0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Psma4Q9R1P0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Psma4Q9R1P0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms