Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4V4

Fbxl3, F-box/LRR-repeat protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl3Q8C4V4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,82■■■■□ 3,16
Fbxl3Q8C4V4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Fbxl3Q8C4V4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Fbxl3Q8C4V4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Fbxl3Q8C4V4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Fbxl3Q8C4V4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Fbxl3Q8C4V4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,01■■■□□ 2,55
Fbxl3Q8C4V4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Fbxl3Q8C4V4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Fbxl3Q8C4V4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Fbxl3Q8C4V4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Fbxl3Q8C4V4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Fbxl3Q8C4V4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Fbxl3Q8C4V4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Fbxl3Q8C4V4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Fbxl3Q8C4V4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Fbxl3Q8C4V4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Fbxl3Q8C4V4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Fbxl3Q8C4V4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Fbxl3Q8C4V4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Fbxl3Q8C4V4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Fbxl3Q8C4V4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Fbxl3Q8C4V4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Fbxl3Q8C4V4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Fbxl3Q8C4V4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Fbxl3Q8C4V4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Fbxl3Q8C4V4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Fbxl3Q8C4V4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Fbxl3Q8C4V4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Fbxl3Q8C4V4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Fbxl3Q8C4V4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Fbxl3Q8C4V4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Fbxl3Q8C4V4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Fbxl3Q8C4V4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Fbxl3Q8C4V4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Fbxl3Q8C4V4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Fbxl3Q8C4V4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Fbxl3Q8C4V4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Fbxl3Q8C4V4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Fbxl3Q8C4V4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Fbxl3Q8C4V4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Fbxl3Q8C4V4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Fbxl3Q8C4V4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Fbxl3Q8C4V4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Fbxl3Q8C4V4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Fbxl3Q8C4V4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Fbxl3Q8C4V4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Fbxl3Q8C4V4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Fbxl3Q8C4V4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Fbxl3Q8C4V4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Fbxl3Q8C4V4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Fbxl3Q8C4V4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Fbxl3Q8C4V4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Fbxl3Q8C4V4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Fbxl3Q8C4V4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Fbxl3Q8C4V4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Fbxl3Q8C4V4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Fbxl3Q8C4V4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Fbxl3Q8C4V4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,51■■■□□ 2
Fbxl3Q8C4V4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Fbxl3Q8C4V4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Fbxl3Q8C4V4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Fbxl3Q8C4V4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Fbxl3Q8C4V4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Fbxl3Q8C4V4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Fbxl3Q8C4V4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Fbxl3Q8C4V4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Fbxl3Q8C4V4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Fbxl3Q8C4V4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Fbxl3Q8C4V4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Fbxl3Q8C4V4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Fbxl3Q8C4V4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Fbxl3Q8C4V4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Fbxl3Q8C4V4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Fbxl3Q8C4V4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Fbxl3Q8C4V4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Fbxl3Q8C4V4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Fbxl3Q8C4V4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Fbxl3Q8C4V4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Fbxl3Q8C4V4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Fbxl3Q8C4V4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Fbxl3Q8C4V4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Fbxl3Q8C4V4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Fbxl3Q8C4V4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Fbxl3Q8C4V4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Fbxl3Q8C4V4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Fbxl3Q8C4V4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Fbxl3Q8C4V4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Fbxl3Q8C4V4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Fbxl3Q8C4V4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Fbxl3Q8C4V4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Fbxl3Q8C4V4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Fbxl3Q8C4V4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Fbxl3Q8C4V4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Fbxl3Q8C4V4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Fbxl3Q8C4V4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Fbxl3Q8C4V4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Fbxl3Q8C4V4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Fbxl3Q8C4V4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Fbxl3Q8C4V4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,4 ms