Protein–RNA interactions for Protein: P14231

Atp1b2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b2P14231 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Atp1b2P14231 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atp1b2P14231 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atp1b2P14231 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atp1b2P14231 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atp1b2P14231 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Atp1b2P14231 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atp1b2P14231 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Atp1b2P14231 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Atp1b2P14231 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Atp1b2P14231 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atp1b2P14231 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1b2P14231 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atp1b2P14231 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp1b2P14231 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Atp1b2P14231 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp1b2P14231 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atp1b2P14231 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atp1b2P14231 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atp1b2P14231 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atp1b2P14231 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atp1b2P14231 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atp1b2P14231 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Atp1b2P14231 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atp1b2P14231 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atp1b2P14231 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Atp1b2P14231 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b2P14231 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atp1b2P14231 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atp1b2P14231 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp1b2P14231 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp1b2P14231 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp1b2P14231 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp1b2P14231 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp1b2P14231 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp1b2P14231 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1b2P14231 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp1b2P14231 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp1b2P14231 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1b2P14231 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1b2P14231 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp1b2P14231 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp1b2P14231 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp1b2P14231 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp1b2P14231 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b2P14231 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp1b2P14231 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp1b2P14231 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp1b2P14231 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b2P14231 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b2P14231 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b2P14231 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b2P14231 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp1b2P14231 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp1b2P14231 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1b2P14231 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b2P14231 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1b2P14231 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp1b2P14231 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b2P14231 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp1b2P14231 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp1b2P14231 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b2P14231 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b2P14231 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b2P14231 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b2P14231 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b2P14231 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp1b2P14231 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b2P14231 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1b2P14231 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1b2P14231 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b2P14231 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b2P14231 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b2P14231 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1b2P14231 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b2P14231 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b2P14231 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b2P14231 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b2P14231 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b2P14231 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp1b2P14231 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1b2P14231 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1b2P14231 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b2P14231 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b2P14231 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b2P14231 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b2P14231 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b2P14231 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b2P14231 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b2P14231 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1b2P14231 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp1b2P14231 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1b2P14231 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1b2P14231 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b2P14231 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b2P14231 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b2P14231 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b2P14231 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp1b2P14231 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b2P14231 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms