Protein–RNA interactions for Protein: O89050

Mkln1, Muskelin, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkln1O89050 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Mkln1O89050 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Mkln1O89050 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Mkln1O89050 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Mkln1O89050 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Mkln1O89050 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mkln1O89050 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Mkln1O89050 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Mkln1O89050 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Mkln1O89050 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Mkln1O89050 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Mkln1O89050 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Mkln1O89050 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Mkln1O89050 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Mkln1O89050 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Mkln1O89050 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Mkln1O89050 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Mkln1O89050 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mkln1O89050 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Mkln1O89050 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mkln1O89050 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Mkln1O89050 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mkln1O89050 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Mkln1O89050 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Mkln1O89050 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mkln1O89050 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Mkln1O89050 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mkln1O89050 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Mkln1O89050 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mkln1O89050 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mkln1O89050 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mkln1O89050 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mkln1O89050 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Mkln1O89050 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mkln1O89050 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mkln1O89050 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mkln1O89050 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mkln1O89050 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mkln1O89050 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mkln1O89050 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mkln1O89050 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mkln1O89050 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mkln1O89050 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mkln1O89050 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mkln1O89050 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mkln1O89050 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mkln1O89050 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mkln1O89050 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mkln1O89050 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mkln1O89050 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Mkln1O89050 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Mkln1O89050 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mkln1O89050 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mkln1O89050 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mkln1O89050 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mkln1O89050 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mkln1O89050 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mkln1O89050 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mkln1O89050 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mkln1O89050 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Mkln1O89050 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mkln1O89050 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mkln1O89050 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mkln1O89050 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mkln1O89050 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mkln1O89050 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Mkln1O89050 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mkln1O89050 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mkln1O89050 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mkln1O89050 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mkln1O89050 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Mkln1O89050 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mkln1O89050 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mkln1O89050 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mkln1O89050 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mkln1O89050 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mkln1O89050 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mkln1O89050 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mkln1O89050 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mkln1O89050 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mkln1O89050 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mkln1O89050 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mkln1O89050 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Mkln1O89050 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mkln1O89050 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mkln1O89050 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mkln1O89050 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mkln1O89050 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mkln1O89050 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mkln1O89050 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mkln1O89050 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Mkln1O89050 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mkln1O89050 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mkln1O89050 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mkln1O89050 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mkln1O89050 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mkln1O89050 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mkln1O89050 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mkln1O89050 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mkln1O89050 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms